- Transcript 'Boleac.CG.SB_v3.S81....' >
- Clone 'AHC0AAA228YF13' >
- Clone 'AHC0AAA220YE24' >
- Construct 'CONS00001065'
Construct
ID
CONS00001065
Name
Ci-Hox1(i2D2)/lacZ
Min Promoter
Reporter
Comment
A 2908bp region corresponding to the truncated second intron of Hox1 gene of ciona intestinalis, placed upstream a putative translation initiation site of Ci-Hox1 (located in the second exon) and upstream the 160bp 5' flanking region, and a lacZ reporter sequence. No variant effect compare to the Cis-reg original.
Show sequence
Length: 2,906
GGTTCGCCTCATTGCGCGTATTTTACGAGGCGGGTAGTGACTATTATCATATTTTATCTA
AGGTATTTATACGCGTCATTATAGAAAATATTTTGAATTTATAAATTTAGGCCGTGACAT
GCTTTAACAACTTTTTGTACGGTTAAAACTAATCGCAATATATAAAGTCCTAATAGTAGG
GTTGTGACACCTTTTCATTCGATTTTATCGTCACATTTAAACAAAAAATATTCAAAAAAT
ATATAAAACCGTATCCTCATGAGACTACTATAGACCGGTGTTAATTGTTTTAAACACGAT
CCGAAAATGTGGACATTATGTACCAAAGGTGTTCCGTCTTCTCCCATAGTACTTGATATC
AATGCCTAATAAGGCTATGTGTCCACTATTTGTTTTTGAATTTTGTGCCCAACGTTTTGC
TAATGCAGCAGTCATTGTGCTTATCTTGGTTTAAAAGGTAATCGTTCCGCATAATTAGCA
TGTTGCTTTAGTAAAGGAGATATGGTCACGTGGTGTGTCGATCACCGTTTTTCGACTTTC
TGTTTATAAAATACATTACAACATCACCAATACTATACCACCAAAAGGAACACGCTATTA
CGCTTAAAAATACAAGTTTCGTATAGAGTAGGTTACGATGAGATGGTCTATGTTTTCATT
CTCTATTATAATCCCATTTAGTATTAAACAACGAATATTTGTGGGTTTATATAATCGTAT
CTTCGCGACCTTGAAAGCGCGTGATTATTTGTTTAAAACACGGTTAGAAAAAAATATGGA
ATTTTATGTGCAAATGGTACCCTACTATATTTATTGGCATTAAAATTGCGTGGTCAAAGG
GAACGTTGTCGTTTCAATGGTCCCTTTATCCGTCATGTGAATGATATCGAAACGCCGCGG
GGTAGATGCTGGGTTCATGAACTCTCTGTCCTTTCGCTCACACTATATCTTTGCGGCGTT
GGGCGTATCGATACCACGGTAAATATGTACACATCGTCGTGTCCTTGTCTACCAGTCATC
CGTAAAATCGACCCAAAACCACAAAAAATTCTACGGGTTTTCCGCTGCCCGACGCGAACG
GCTATGCGTTACTTTCAGCTAAAGTACTCTTTTAACATGTATTGCTCTTTATTGCTGTTA
TTAGATTTATAAAACTTGTTTCCAAATAAGAATTATAGTGTGGTTATCTGTGCAGCACAA
TGTGCTTATATACGACGCCAGGTTAGAACACCTTGAACTGGAGTATAGATGCTAAATTTC
TCGAATAAAAGCAATGCACATTGAAAACAGATTTTACCTAAAATATATAAAATTAAGCCG
AGTATATTTGTACTAACGTTGCTATGTTGCGTCTTGTTCAAGCAACAAGATATTGCCGCT
TAATGCACTGGGAAACCGTGGAACATCAAGTACGGTAACCATTAAGACGAATAGCGCACA
GCACGCGTATTTCTATTTATCATTAGCGTGTAATATTGGAGTTATAATTACGGAATGCAG
ATTACAATATCTGTTTTGCTCCCATGGCCTCGATCAATTGCATTGTGTCCTCATTTGTCA
ACTGAAGCATTGCAATTGGCATTATTATTCCATTATCGAAACAAAAGCTGGCGTTACGCG
TGGTTGGTCCACGGAGACCAATCTCAGTCACGCGTTTGGGTGTCGCTTTTCGTCACTTCG
ATTTTTAAACAAAATGTGAGATATCGTTCACCATCTGACAATTTTTATATTGTAAACCAA
CATTGATCATTCGAAAAAATCTTTTATCGTTTTTTAACTTTTTCAAAAAGAAGCGTTTCA
TAGCTTTAAATAAAATGAACTGGAATTAATTTAATATAAAAAATTGTATAAATACATCTG
TCCAGCTTTAACAGTTTATTCATGCATTAACAAAATGGTGTGAAAGATGTGACATTTAAG
GACATATTTCCCAATATTTAAAAAAATAAAATAGATGATGGTTTTCGGGTGATGCTACGA
ATTAATACTATCATTCCCTTATTACAACTCAAAAACCGATTAAAACACACGAGGAGTTAT
TTAGCGATTCACACAACAGATGTAATTTTACCAGCTCGAAAACAAACAGGGTGAGACGGG
GCAGTTTAAAACCATTGTTAATTTTTTTCTGAAAATTAAGTTTAAACATTCTTCTCCTTG
CTCTCTAATGCTATAGTTTTTAGCAGGTTACCCAAACCTACATTATATTATTTTATGAAA
ATTGGTTTTGTTTAAACAATAATGAGTATTGTTCGAACATCAATTAATGAATACTATATT
CTAGAAATGCATATGAACTTGCAAAAGCAGAAAATTGATAATAATTATCAATGAAGTTTA
CCTTTCTGCTACATTTGGATATTGCTACGTTATATTTCACACAAGCCACTTTTCATATTT
TACCTCCAACAAGTGCCCGTGACTAAATTTCCAATATACTTTTCATAAAAGTTTTTAATT
AACCTGTATAATATATTTCTTTCCATGCAGCTGTTAGTTTACCTATCTAAATTAACGAGC
ACTACTAGTTTATTTGCCACGTAAACATTATATATAAAACAAAATACAAAACTTCGGAGA
CCTACAAAAGTTCGGAAGCTTTTAATATGGTTTAGCGAGCATTTTTAAAGAACAAATACT
TTAATATTACGATTTTTTCAGCCATCGAAAAAAAGCTTTCTTGAACACCGAATTGTTTTT
AGTGAGGAAGAGTCATCGGCATTGCGCGCGCTTTATATAGATTTTAGATTGTATTGTAGA
ATAATCCTGTAAAATTATTTGTGTTAACCCGTAAAACATGAGTACCGGGAAAAGGTTTCC
CATCTTACCTCACCGTACTATATAATAGGTTCGTAATTAGTAAATATTAACCTACATACA
CTAACAATGTTTTGTGTCTGTTTTAG