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  1. Construct 'CONS00000033'
  2. Construct 'CONS00000600'
  3. Construct 'CONS00000853'
  4. Construct 'CONS00000628'
  5. Construct 'CONS00001067'

Construct

ID

CONS00001067

Name

Ci-Hox1(i2D3)/lacZ

Reporter

LacZ

Comment

A 2330bp region corresponding to the truncated second intron of Hox1 gene of ciona intestinalis, placed upstream a putative translation initiation site of Ci-Hox1 (located in the second exon) and upstream the 160bp 5' flanking region, and a lacZ reporter sequence. No variant effect compare to the Cis-reg original.

This construct is testing Regulatory Region

:

Sequence

Show sequence

Length: 2,328

CACCAAAAGGAACACGCTATTACGCTTAAAAATACAAGTTTCGTATAGAGTAGGTTACGA
TGAGATGGTCTATGTTTTCATTCTCTATTATAATCCCATTTAGTATTAAACAACGAATAT
TTGTGGGTTTATATAATCGTATCTTCGCGACCTTGAAAGCGCGTGATTATTTGTTTAAAA
CACGGTTAGAAAAAAATATGGAATTTTATGTGCAAATGGTACCCTACTATATTTATTGGC
ATTAAAATTGCGTGGTCAAAGGGAACGTTGTCGTTTCAATGGTCCCTTTATCCGTCATGT
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GTGTCCTTGTCTACCAGTCATCCGTAAAATCGACCCAAAACCACAAAAAATTCTACGGGT
TTTCCGCTGCCCGACGCGAACGGCTATGCGTTACTTTCAGCTAAAGTACTCTTTTAACAT
GTATTGCTCTTTATTGCTGTTATTAGATTTATAAAACTTGTTTCCAAATAAGAATTATAG
TGTGGTTATCTGTGCAGCACAATGTGCTTATATACGACGCCAGGTTAGAACACCTTGAAC
TGGAGTATAGATGCTAAATTTCTCGAATAAAAGCAATGCACATTGAAAACAGATTTTACC
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CAAGCAACAAGATATTGCCGCTTAATGCACTGGGAAACCGTGGAACATCAAGTACGGTAA
CCATTAAGACGAATAGCGCACAGCACGCGTATTTCTATTTATCATTAGCGTGTAATATTG
GAGTTATAATTACGGAATGCAGATTACAATATCTGTTTTGCTCCCATGGCCTCGATCAAT
TGCATTGTGTCCTCATTTGTCAACTGAAGCATTGCAATTGGCATTATTATTCCATTATCG
AAACAAAAGCTGGCGTTACGCGTGGTTGGTCCACGGAGACCAATCTCAGTCACGCGTTTG
GGTGTCGCTTTTCGTCACTTCGATTTTTAAACAAAATGTGAGATATCGTTCACCATCTGA
CAATTTTTATATTGTAAACCAACATTGATCATTCGAAAAAATCTTTTATCGTTTTTTAAC
TTTTTCAAAAAGAAGCGTTTCATAGCTTTAAATAAAATGAACTGGAATTAATTTAATATA
AAAAATTGTATAAATACATCTGTCCAGCTTTAACAGTTTATTCATGCATTAACAAAATGG
TGTGAAAGATGTGACATTTAAGGACATATTTCCCAATATTTAAAAAAATAAAATAGATGA
TGGTTTTCGGGTGATGCTACGAATTAATACTATCATTCCCTTATTACAACTCAAAAACCG
ATTAAAACACACGAGGAGTTATTTAGCGATTCACACAACAGATGTAATTTTACCAGCTCG
AAAACAAACAGGGTGAGACGGGGCAGTTTAAAACCATTGTTAATTTTTTTCTGAAAATTA
AGTTTAAACATTCTTCTCCTTGCTCTCTAATGCTATAGTTTTTAGCAGGTTACCCAAACC
TACATTATATTATTTTATGAAAATTGGTTTTGTTTAAACAATAATGAGTATTGTTCGAAC
ATCAATTAATGAATACTATATTCTAGAAATGCATATGAACTTGCAAAAGCAGAAAATTGA
TAATAATTATCAATGAAGTTTACCTTTCTGCTACATTTGGATATTGCTACGTTATATTTC
ACACAAGCCACTTTTCATATTTTACCTCCAACAAGTGCCCGTGACTAAATTTCCAATATA
CTTTTCATAAAAGTTTTTAATTAACCTGTATAATATATTTCTTTCCATGCAGCTGTTAGT
TTACCTATCTAAATTAACGAGCACTACTAGTTTATTTGCCACGTAAACATTATATATAAA
ACAAAATACAAAACTTCGGAGACCTACAAAAGTTCGGAAGCTTTTAATATGGTTTAGCGA
GCATTTTTAAAGAACAAATACTTTAATATTACGATTTTTTCAGCCATCGAAAAAAAGCTT
TCTTGAACACCGAATTGTTTTTAGTGAGGAAGAGTCATCGGCATTGCGCGCGCTTTATAT
AGATTTTAGATTGTATTGTAGAATAATCCTGTAAAATTATTTGTGTTAACCCGTAAAACA
TGAGTACCGGGAAAAGGTTTCCCATCTTACCTCACCGTACTATATAATAGGTTCGTAATT
AGTAAATATTAACCTACATACACTAACAATGTTTTGTGTCTGTTTTAG