- Construct 'CONS00000696'
Construct
ID
CONS00000696
Name
pCi-Hox1 -2488/502 Intron 2 added::LacZ
Min Promoter
Endogenous Promoter
Reporter
Comment
This region was named Ci-Hox(intron 2) in the paper. In this construct, a part (1.9kb) of the second intron of Ci-Hox gene was added between nucleotide -991 and -897 (the region between was deleted) in the regulatory region of Ci-Hox1.
The conserved element and the DR-2 RARE motif were still present.
Show sequence
Length: 4,802
TAGATTGATGATTCAATATGAGGAACGTAATTTCGGTTATAATAGGACTCAGCGAGCATT
CAAAATTACAATCTTGTTTAAGGATCTCCTACTTAGGTTTTATGGGCATACTCAAGAGGC
ATACCAACAAAAGTTCAAAATTTATTAGGCGGAGTTGCTAAATATTCTTTAAAAGTACCA
CTAAAGTTTCAAAATACCAAAAAGCTTTTAAAAAAATGGCGTGAAATTAAAAAGTTGTAT
GGCGAACTCACACTCAACTTAGATTGGTAGCTTCTACTGCAAAAATGTTACATCTCGTGT
CGTATTTTTTTCAGCTCTCAATAACACCGCAATAACATGTTAAAAACTGTTATTGCGGTG
TTTCGATAAAAGGAACACTTTCGATAAAAGGAACATGGTGATATTTATTTAAAAAGAGGG
AAAAAATGGCTTAACTGCGATTTTAGGATATTTTGGCGAACCTAACCTGTTATATAGGCT
ATTATGTTACTCATGTGCGAGTTTACTTAATATACATTATTGAGTAGGCCATGACGCGCT
TAAACTTGTAGAAGAAATAAATTAAACTCTACAAATATATTAGATAGTACTTTAAGCTAA
ATCCACCGTTACATTTATTGCTGTTTAAAACGGTACCGATTTCGAGTTACTGTCACTTAC
ATATTTTAGCGGTAACGTAACTGGTGCATCTTGATTGTGCACAGCCAATCTCTTACAATG
GAAAATGCCGTGCTGCATATTTTCTTTTGGCGATGTCTTGGAAGCGGCTAAAGATTTTTA
TTTCACAGACGCATAAATACTTTTAGCCTAATATTTGTCAAATATTTATTATCTACAAAC
GTTGCTTTAACGCAAATAATTTTCAAAGTAAAAGTCCGCTATATCGGTCTGTGTTAACTT
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TAAAGCTGCAGTGCATAAAAATCGTTTCTAAAAATCAATAAAATCCTATCAAATACAGTT
AACCAATATGCATCCAAATTTTATGATTGATTTATGATACATACCAAATACTAAAGTATT
AACCGCAATCACGCTTTTAACCTGTTACGATAGTATTTATGAGTTAATAGAGTATTTATA
TAGCTCGAGCCATGGCCTACTCGAACATATGTTTCAGTAGGCCATGCTCGAACATAAGAA
ATTCAGATATAGGAACCTGTTTGTTCTTCATCGCACAGCATTTTCTTTTTGTCATCACAT
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ACGAATCAACTTTCAAATATATATTCACTCGGTAATATTGCATATAGTTTTTAATATTAT
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ATATCCTTATTGTCGACCTCGAGCGTTTCTCTCTATCAGATCCCGCGTGACATCATAATA
GAGAAAGTAGTGAAATAAAAGACAGATTGAGTAGTTACTTGCTTTATTTATTGGCGCATC
GTAGGTTCGCCTCATTGCGCGTATTTTACGAGGCGGGTAGTGACTATTATCATATTTTAT
CTAAGGTATTTATACGCGTCATTATAGAAAATATTTTGAATTTATAAATTTAGGCCGTGA
CATGCTTTAACAACTTTTTGTACGGTTAAAACTAATCGCAATATATAAAGTCCTAATAGT
AGGGTTGTGACACCTTTTCATTCGATTTTATCGTCACATTTAAACAAAAAATATTCAAAA
AATATATAAAACCGTATCCTCATGAGACTACTATAGACCGGTGTTAATTGTTTTAAACAC
GATCCGAAAATGTGGACATTATGTACCAAAGGTGTTCCGTCTTCTCCCATAGTACTTGAT
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TGCTAATGCAGCAGTCATTGTGCTTATCTTGGTTTAAAAGGTAATCGTTCCGCATAATTA
GCATGTTGCTTTAGTAAAGGAGATATGGTCACGTGGTGTGTCGATCACCGTTTTTCGACT
TTCTGTTTATAAAATACATTACAACATCACCAATACTATACCACCAAAAGGAACACGCTA
TTACGCTTAAAAATACAAGTTTCGTATAGAGTAGGTTACGATGAGATGGTCTATGTTTTC
ATTCTCTATTATAATCCCATTTAGTATTAAACAACGAATATTTGTGGGTTTATATAATCG
TATCTTCGCGACCTTGAAAGCGCGTGATTATTTGTTTAAAACACGGTTAGAAAAAAATAT
GGAATTTTATGTGCAAATGGTACCCTACTATATTTATTGGCATTAAAATTGCGTGGTCAA
AGGGAACGTTGTCGTTTCAATGGTCCCTTTATCCGTCATGTGAATGATATCGAAACGCCG
CGGGGTAGATGCTGGGTTCATGAACTCTCTGTCCTTTCGCTCACACTATATCTTTGCGGC
GTTGGGCGTATCGATACCACGGTAAATATGTACACATCGTCGTGTCCTTGTCTACCAGTC
ATCCGTAAAATCGACCCAAAACCACAAAAAATTCTACGGGTTTTCCGCTGCCCGACGCGA
ACGGCTATGCGTTACTTTCAGCTAAAGTACTCTTTTAACATGTATTGCTCTTTATTGCTG
TTATTAGATTTATAAAACTTGTTTCCAAATAAGAATTATAGTGTGGTTATCTGTGCAGCA
CAATGTGCTTATATACGACGCCAGGTTAGAACACCTTGAACTGGAGTATAGATGCTAAAT
TTCTCGAATAAAAGCAATGCACATTGAAAACAGATTTTACCTAAAATATATAAAATTAAG
CCGAGTATATTTGTACTAACGTTGCTATGTTGCGTCTTGTTCAAGCAACAAGATATTGCC
GCTTAATGCACTGGGAAACCGTGGAACATCAAGTACGGTAACCATTAAGACGAATAGCGC
ACAGCACGCGTATTTCTATTTATCATTAGCGTGTAATATTGGAGTTATAATTACGGAATG
CAGATTACAATATCTGTTTTGCTCCCATGGCCTCGATCAATTGCATTGTGTCCTCATTTG
TCAACTGAAGCATTGCAATTGGCATTATTATTCCATTATCGAAACAAAAGCTGGCGTTAC
GCGTGGTTGGTCCACGGAGACCAATCTCAGTCACGCGTTTGGGTGTCGCTTTTCGTCACT
TCGATTTTTAAACAAAATGTGAGATATCGTTCACCATCTGACAATTTTTATATTGTAAAC
CAACATTGATCATTCGAAAAAATCTTTTATCGTTTTTTAACTTTTTCAAAAAGAAGCGTT
TCTCGCGACCTGTTTCGGTTTATTCCATTACAATAGACCGACATGTCGACGAACGATCAT
CATGCCAACATTTAAAATACAACTTTAGGTATTTTCCATTGGATTTAGAGCTTACAAAGA
CCAGATTGTGTTACCTAGTGTTCAACCATATTCAAATGCAATTAAATGCACTGCCAACAG
CGTGTTTATAAACACTATTCGGTGCTTCTATGGGATGCGTGAGCAATCTATATGTGAAGT
ATAATAAATCTTCGTGTAGTAAAATTGTTGTCAATATAAATTTGTAAACATTTTTTTTTT
GGTTACGAATTTACCAAAACGTAATGTGGTTAAAGCGACTAAAATTTGCAGGAGATTTGC
TATGTTTCTTATATTAAAATTGGAGATAATGGGCATTGTTTCTGTGACCGGACACTGGAA
ACAACAACAAAATGAGAAACGCGCCGAAAGCTCGAAGATAATAAGCAAACAAACGATGAA
CTTTTCACCCTAGAGTGAAGACCGGACAAGTGCTCTTGTCCGAGCGCGGACATTGCTGTT
TTTACAAGATGAATAAAAGAAACAAAAAACTCTCGTGTGCGTGGAGAAACAAGGAGAGAA
TAGAAACGAAAAAGTGTGAAAGAAATAGGGGAGCTTGCGTTTGTATAAAACGAGGTGCTG
GACGGGTTAGAAACTTCTCTGCCACAGATTGTAAAAGGCAACAAACCATATTTAGTATGT
TTCGCTTTGAAAGAAATAGTGTTTGCATTTTGGACCAGTGTTATATTGTATTGCTTTATA
CTAGTAGGTAAAGAAAAAACTAAAAAATTACTATTACATCGATGCAAACATTGGCTAAAT
ATGAAGTTGGGGTGTTGCGTTTAATCTTTGCTAGTACAGTATTGTGGTTTACTAGGTTGT
TTAGACTTTAGGTAAAATTAAAGTTAAAACAAAAATTGTAGCAGCAACACACGAAGGATC
TGCACAGCTCGTTAATAGGTATGTGTAATTATTTTTACTGATAAAATTAGCATTTAAGAG
TAGCCGCTGCGGCATTGGTATTCTGTTTCTATTTTTATATTTAGTCATTTTGATAGTAAT
TCAACATCAATTAAATTAACGTACCATTATTATTATTCCTACCAATGTTTACCTAAAATT
CAAGCAGATACATTTGTAATTAACCATATAACGTTTATTATTCGATTTACACGCGTATTT
GAAGGACTGAAAATGAAGTTTGCTTCAATTTAGGAATCTCATTGTACGTCGATATAGCTT
TGCGAATTTGGGTAAAAAGCGTTACACAACAACGGCTTATTAGAACCTTATTTACTGCCA
AGACTATTAAATACTCTTTTGTTAGAAAGGTGTAAGATGAATTCGTACATGAAATACCCG
GT
