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CONSTRUCT

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  1. Construct 'CONS00000280'
  2. Construct 'CONS00000816'

Construct

ID

CONS00000816

Name

pCi-Tbx6b -2339/-13::LacZ

Min Promoter

Endogenous Promoter

Reporter

LacZ

Comment

Construct containing the region upstream of Ci-Tbx6b from -2339bp to -13bp and able to drive muscle expression.

The Ciona Tbx6b (Ci-Tbx6b) 5-flanking region was PCR-amplified using the following primers: 5-AATGTAGCGTCGCTTCACAACCAGTCG-3 and 5-GAGACTCGTTTTCGATGCCACTTTG-3

This construct is testing Regulatory Region

REG00000853: Ci-Tbx6b -2339/-13

Sequence

Show sequence

Length: 2,326

GAGACTCGTTTTCGATGCCACTTTGATCTTAACGAGTCATTAACAAGGACAACTGCTTCC
TGATAAGCCTCCGAACTCTCCTGCTGATTCAAGTCTAGCGCATGCAGAACACTCCAAAAC
TCAGTGTGACGCATACCGTCTTGCATGTGGCGCGTTGGTTTGATGAAATCGCTTTAAAAA
TGTGTTTGATAATTTCATTATTATGGTTTGATGTAGAATAGCCTTGTTAGTTTTTTTTAT
TAAACAGCTTCGTTTATAGAGATTTAAAGGTAATTTTGACAACTAAGTTGACAGTCCGCC
ATATGAAGCCATTTCCTAAATATGTTATGTGTTAAGTCTATTGTTATTAGTAGACAATAG
TTATCGTACGTTGTTACCAATGTCACCTTCGCTTTTGCAAGCTTGTTACGTTGTTAACCA
GTTGGGGATCATCCGTTTAAGAATGCGACATAAGTCTGTCACAAAAACTAAAATTTTATT
ATATAGTGCTGTGGGGTAAGATGGGACACATTCAGAACATAATATCCTTATCGTGTTTTT
AAACAATTAACAACGGTATATAGGATTCGTAAGAAAACGGTTTTCCATTTCTTTGAATGT
TCTTCTTAAAAATAGAACGAAAAGGTCTTCAAAAAAGTAACGATAATTGTAAAACGTTTC
CATCGATGGCTAAAACCACATACGTTTAGGTTAAACCCTTATTCTACTCAAAGTTGCCTA
ATAGTTTTAAAAATATTTTAAATCAATTTGATTAAAACTAATATATGGGTATGTCTTGCA
TAGTTTTATATACCGCCGTATTTAGTGTAGGCCTCTTATGTATTATTGTAAGCAGAAAAC
TAGCCAAAATATTGCCCATAATATAGCTCGGATTATTGTTCATTCTATGTATATTTCGCA
CTTTAATGGATAGGTTCGAATTTGATTTAGTTTAGTGTATCAATATAGGTTTGGTCTTTG
TGGTGGATCAAAAAATAACGCTTACCGCTTTTCCTTATTATCGCACCAACACCGCTTGCA
ACCAGCAATTTCGAAAGGTTACCGCAGCGGGGTCCTCATTACTTATCAACAGTTGTTCGG
TAATTACGCCATTAAACTTGACACGCGTACTCCGTTGATTACTTTCTCGCTCACAAAAAC
TACGTGGAGCTCAGTTTCGATATACCTTATTTTTAAACTAACGAAAGTAATTTATAGTAG
GGTGGGGGAAGATGGGACACATTTTCAATCTATTTTCTCCTCCAATTTGGTAGTAAACAA
ACATTCAACGATATTTTATAAAACTTTATCCTCACGGCTCCCATAGATCGTTGTCAATTG
TTTAAAACACGATCAGGATATTTGGTTATTATGTGTGAAAGGTGTCCCATCTCCCCCCAT
CCTACTATACAAATACTACATATGTTATTTAAAATTGCCAGGGCAAAACGTGTATATTCG
TACAGTTAGCACACTGATCTACTAAAGATTTTAACATGTTCCTTAAATGTCTCCCTGACA
CCCGATGCATAGTTTGTTTTAAAACTGGGCTTTCGTGATGTTGAAAAATATCCTGAAAAT
GCCGGGATAAGCTGTATTAATATATTTGTATTCCGACAAAAGAAAATTAAACTGAACCCT
TATGTAGCTAAGTTTAATCAGAAAATTATAGTAATCTGTATTTTAAATAAATTAAAAAAA
ATATAATTATGTTCAAGTAGTTTAGAAGCTATTAATTGTCAACTATAAGTTGGATCATTT
TTATGGGTATATTTGTAGGCACATTGTTGCATCGCCATTTTTTTTACTGTAGCGGTTTGA
TTTTTTTCGAAGGCTGTTTTGTGTTTTTCAAACTTCGGTGGTGCATTTGGATCACATTTT
ACCATCTATATCCGTAAACGAATTCAAAACAATATATGCATGCATAGCGGGCGCTTGCGG
GTGGGTTATAGGCAAAAACTATCCATGTTAATAATGTAACATTTTCCATTTTTAAACGGT
GTGAAGCGCGTTGCGATACAATACTATATATTTAGCGGGGATGCAGCATCTTCAGTGAAT
TTTGAGGTAAACTGAAATACCCTATGCATTCAACTTCAAATGGATTGATGGGAATGGACA
TCAGTTCGGTTGTGGTAAGCATAAGTGGTGTACTGAAACACTACCAAAATGTGCCTTTTC
TGCCTTATGATCGCTGAATATTCTTTGTATTATTCGCGTTCCACCAGGGATTATAACATG
AGATGGAAATACATATGGTGGTGGTGGCTTCTGTGACAGAGAAATGCTCCATTTATGTAA
TACGAATCCTTAAATTGGGCGACTGGTTGTGAAGCGACGCTACATT

Reference(s)