- Construct 'CONS00000620'
Construct
ID
CONS00000620
Name
pCi-RhoD -3406/1048::LacZ
Min Promoter
Endogenous Promoter
Reporter
Comment
this region drives RhoD expression in notochord, TVC, muscles and mesenchyme.
The sequence was retrieved from the JGI v1.0 assembly using the sequence found in the paper.
CTCACGTCTCTAAAATAGATTTCTTGATTGTTCATATCGCGTTTAGAAAATATGGTGTAA
TATGCGCGAATCCCATCTTACCTCATGGTACTGCAAATCGCATAAGCGCTGTGACGTGGG
TAATAGGAATAATACAGCATTACAGTAACTAAACACCAGTGAAAAATTACTGTAAGCGTG
TTTGCTCCGGGCGTATTTGCTGCGAACAATGACGTCATTTGGTTTAATGTCTTGCGGCCT
TAGAAATCGTGCGTTTACTTTAGTTTAGCCCCAATTCAAATCTAACTTTTTAGCGAATTA
AAACTTTCGGTCGCTTAACTGGCATTGTGCGTGTTAACAAAATTTTAATACCCAAATCTT
AGGTCCCATGCCATGTCACGCTGTAGGACCTCTCAAGTAAAACAATAGAACTACTGACAG
TGTTTAGAAAGTCAAATAGATGCACAATTTTTCCGAAATCCTTTATAATTAATTTATTTA
TTCGCAACAAGAGACACGTTTAGGCGGTAGAGAGCAACTATACAACAAAATCATTATGTC
ACACATGCACTAACTTAACTCGTAAGCAGACACGAGGTGTATAAAAGCAAAACCTGGTTA
TTACCACTGCCGTTGCTCTGCCACGCGAAGATAAGTAAATTCCATTATTCTATAATTACA
GATACACAGGTAGTCTAAGAACTCCGGTAATGAACCGAATTTGGCTTAATTCCTAAGTCA
TGTGATAAGGATACAGAATATATGGGTTTCTAAAATTTGTTTTTTAAGCTATACCACCTA
CAAGTTGTCGTTATCCTAAATTTCAATTTAAAAACTTTACAGCGGTTTATCAAATTTATT
AGAATGAAGAATTTCAAATGTGTAGAATTGTATTGAGATATCTAAGAGAGCAACGTAAAC
ATAAAGTAAACAGATAACACCCAACTGTCGTTCACCAGAAATGCAAACACTCAGACCGCG
TTCCATATATAGTATGGTGGGGGAGATGGGACACTTTTTCATTCTATTTTCTCGTTCCAT
TTAGTAGTAAACAAAGAACACTTGAAGAAATATAAAAACCACATTCCCACAATTCCCATA
GACCGTTATTGTTAATTGTTTCACAATCAAAATATTTGGATAATATGTGCTAAAGGCGTC
CTATCTTCCCCCACAGTACTATAGTAGGGTGGGGAAGTTGGGCAACCTTTTTATTCCACT
TTATCGCCCCATTTGGTAGTAAACAAAGAACAGTCAAAGAATCGTTAAACCGTATCCTTA
CCGCTGGTAATTGTTCAAAACACGATCAAGATATTTAAATACTATATACGTTCTAATGTT
GTTTCGTTTTCTCCACCCTACTATATGTTATTAAAATTTGATTCTTCCTGTCTTTTCTAT
CATGAAGCAATATCATTGATGTTTATACTAACTCCAAATGTTCATGTATATGTATACATT
CATATGTTTTGCATATTTTTATATACAGAACCAATGTTAAATATACTGATATATATTTAC
TAATACATACCTATATAACAGTTATATAAACACCTATATACCCACTGTACCCAATAAATA
ATATATACATATACAGCATAAGTCTATTACACCACCTTTTAACAAATACACATATATTCG
TCTTAAGCCTGTCTTTACCAATAATACAGAGTACCCTTAAAACATGTTATCGTGTACCTC
ATCCTATCTCACTAGACGAGACATTTTACAGTAGAAACAAAATAAGCTCTGATTGTGTTT
CGGTTGCGACGAATGTTGCTACACCATGGTCTATTAATAAAGACGTGTCGGCTGTATAAT
AATGTAGTCTACACCACGGTCAATTAAATACGCCAAGTATGCTTATATAATACATTGAGT
AGGACAGTGGGCCATGTATACACAAATATATGGACTATTTATAAGTGGGTTAATGTGTGT
ATGTTGTTGCTAGTATATAGCTATTAGCAGTGTGATAAACGTATACAAGAATATTGCATC
TGCATTCGCCTTCCAGTCTGTTCCTGGATTCTTGTTTATGTTAAACAGTTCTACAAACCT
AAGGCACACAGCGCGTGCGTTCGTGCTGGTGTGTATAAAAACACGCCCTCATTGCGTAAA
CGCTTATTGACTGACAAGACCACAGTTTCCTGTGAGTTGCGCGAGTCTATATACTGCGGC
AAAAGACGTTAGAAGGCTGTGACCTGCTGGAAAGCCTTTGCCAGCTAACCTACCGTATCG
TATTTAGCGGCTAGTCTTTCAAGTCAAGTTGTACGAATCGTTTTAGTTGTATTCATACGT
CGCGAGCGGAGTTAATTATAGTGACAGATTTTTGAACTAAATGAACGTAGTTATAAATAT
TGTGAGTGAAATTCAAGCAGTAAGTGTATATAGTTAGAAGCATATGAAGTCATGGTGTAT
ACCATTTCGCAAAGTGTTAAAGAGGACAATTCAATACAGTCAACACGGTGTATAAAGTGC
CGAAGTATGGGTTTACACTATTTTAATATGGTTTGTGTGAGTTGTTGTACATTTAATTTT
TGAAATCAAGCTCACTGTACAGTTTGACGACTTGCGAATAGGTCGAACATGATTACATTT
TAGCCAGAATTAGTTATGAGTTTCATGGTTAATTTTACTATTTCCTAAACGCTGTCAATT
TACTGTGTATTATTAGATCTACTAGCAATAAAGTAATGCATTGCACGAGGGTTTAGTAAC
AAAAGCATGTTAATAACCGGGTTATAAATAACTCAGAACGTTTCGAAAATCGACATAGTG
ACTGGCCTACTATATCACCGAAGACGTAATAGACTATATATGCATAACACGCACATGCTT
TGCGCCATGTATATATATGATATTTGAATATAGATTTGATCACGCCGAAAGCTGTCCAGA
CTAAGAATGCTTACAAAGGTAAGTTTCAGACAGTTCTATAAAGTTACACCAGCGTTATAC
AAAGGATCTGTATGGCAACGTCAGACAATTTGCGTAACAGGAAGCAGAACTACTTGTTTC
TAACGTCACAGTCCCCTAGCGGCCTAGTGAATAACGGTGGCGAAAGATAGATAGTAAGTT
TTTTTTATTGTTTTATGTCCTTGGAGAGGTAAATAAATTAACTAGGAGATGATTGAAAAA
ACATTATTACGTCCACAATATGAGTATAGTATAGCATTGTAAGGTTGTATGTTTGAGTAA
GACTATCTAAAAAAGATAAAAAAGAGATGAAGTCTAGGATTTGTTTTTCTTTTTACAGCA
TTGTCGTTCAATTACCGCGTATATATGTATTTGTATTTTTAAAATTTAGCGTATATTTAG
CTGCATTTAAAGATAAAATGGGCTACTAAAGAATCCTCCCCAACTAACTGCTAGTCTAAA
TAGTATTCTTCACTACTGTAACAAAGTTGCATTTCTTCTTTTAGTGACTGGCATCACTTC
TTAGAATGTAGTTGCTAATTTTAACTTGTAAAGCCAAAACTATACACAAACAATGGAAAG
GATACCCAATGACGTCAAAGGTGCTTTCCCCGAGCAGCAACCCAAAATTAAATGTGTTAT
AGTTGGGGATGGTGGATGCGGTAAAACTTCAATGCTGGTTGTATATACGGAAGGCGAATT
CCCTGAAGTAAGTTTACGTTTAATTATAAACTTTTTTGTATAGTTGTCAGTTTCAATACA
AATATAGTGGGATGGGGAAAGATGGGACAACTTTAACACCTAATATCCAAATATTCTGGT
GGTGTTTTAAAGAATAAACAATGGTCTACGCCCTACGGGGTCGTAAGGATACGGTTTTAT
GATTCTTTGTATGTTCTTTGTTTACTACCAAATGGGACGAGAAAATCGAATGAAAAGGTG
TCCCATCTCCCCCCACCATACTATATATGACAGTCCGTATATATACTAGGGCGAGCAGGA
TAATTGGATAATATGTGCTAAAGGAATCCCATATCTTCCTTAACAGTACTATTTGGTATA
GTTTGCTTATACTAAATTTAATTAGCAACCCGCTGTTGTTCAAAGGTGTACACGCCCACG
GTGTTTGAGAATTACAGCAGAGAGGTGGAATTAAATCGAAAGAAGGCGGTGCTAACATTG
TGGGATACGGCGGGTATATATTAGTACATACGTGTTTATGCAAGACATCGTAGGCTTGTT
GACTTAGTTTCGGTTAGCATGGAAGTGTAGTCTATGTTCTACGTGGGTTATGTTCTTGTC
GAGGATCTGGGATTAGGGCTAAATTCAGCCTATTATTACCACAACATTCAGACTGCTTTT
GTAGGTCCAAATGTAACATATGACTAGTGTGTTCTGATGTGTGTTTATAATACAATAAAC
TAGCGCAAACTGTTTGTCCCATTATGTTTAGTCATATAGGTCATATGAGAGTAAATGAAG
TGTAAACCAAATGTTTACTTGTACCAGGTCAGGAAGATTATGACCGGCTTCGACCTCTCT
CTTACAACAACGCA