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  1. Construct 'CONS00001539'

Construct

ID

CONS00001539

Name

p.Cirobu.REG.KhC2.5771334-5773564>Kaede::nls

Min Promoter

Endogenous Promoter

Reporter

Kaede

Comment

The 2.2kb upstream of Msx (C2.957) TSS drives Kaede expression in the neural plate border. The reporter gene is targeted to nuclei (Kaede::NLS).

This construct is testing Regulatory Region

REG00001500: Cirobu.REG.KhC2.5771334-5773564|Msx

Sequence

Show sequence

Length: 2,231

CTACGCATTGATGTCGCAATCTCCCCAAGTTTCCCACCACCTATATGAAAGCTACGAAGG
CGGAAAGATTTCGGCATAATAACCTATTGTTGACGTCATAATCGACCGATAAATAAGCGG
CGAAGATCGCGTCCTCTACAATAGGAGGTGGAACACTCATAAAAAATCACAGCGGTAAAG
CCGCTACCACACGCTGCTAACATTTATTAAGGAGACATGCTACACTCGACGTCATAATGC
GCGTGACGACTATATTGTGACGTCACAGAGAGATAAATAGGATATTTATTGCGCGGTAGA
ATAGAACGACGAGCAATAAAATGAAATGAATTTTGGAAATGGTAAATTAATTTATTTTAT
AAGTCGTCTAAACTTTATCCATTTCCGTATAAAACACGACTTTTACCAACTGTTAATTTT
TATTAACTTACCACATAAAGTAGTTTATTGGGCCGCTCTGAACGAATGGAAATCACCGTA
CTCTATTAAGTTGATCGACCTTTTACATTTCAATATGTTAAAAATCGTACATTAAAAAAA
GATATAGTAGGATGGGGGGATGGGATACGTTTTCATTCTATTTTCTTGTCCAATTTGGTA
GTAAAAAAGGAACTTTCAAAGATTTATAAAACCGCATCCTTACGACTTTCATAGACGGAT
GGTAATTGTTTAAAACACGAACAGTATATTAAGATAATATTTTCTAATGGCGTCCCGTCT
TCCCCCGCCCTACTATATTAAAAAGAGGCAATATGAACCAATACTTAAGATTTTAGTTGG
TGCACATCAATTACTGTTTTTATAAGTCCATGCAGACCGATGTCCATTTACCAGTGATTA
AACAGGGCAATAAAATTACGAAGAATCGCCTTGCGTCGCTGCAAACATATTTATTAGGCA
TTAGCAAGTGTGACGTAATAATGCCTCTTGTTCGACGTGACGGCGAGCGCTTGCTTTTGA
AACACCGCGACGTCGACGAAGACGGTGTCGTAACTTAACAATAGTCTGGGGCCTATGATG
TCATAATGCCCATTTGGTGCACTCGCGTGCTGTCGCCCAAAATCGCAATTAACTCGATGA
CACTGGCAGCATATGACGTCATAAAATGGTTGCCAGGGTCCCGGACCGAGACAGTAATTC
ACTTTTATGACCCGAATATCTAATGGGACCCATGATGTACACTTAGAAGCACGCAGCAAC
TGATTATTAATGTTGAGTGTGTTACGGATGACTGTTAATTTCACAAACAAACAAAAAAAC
AGAGTTCGTTGGCCTTTAGATCACTATTAGAAACAACAGTAATTGGTGGGAACTTGTTTC
GGAGCGAGCCAAATAAAAAAGCTAAAACAAACATAACAGTAAAGCTTAATTAAAATAATA
AGCGTTGTTAATAAATATTAGCATATAGACCAAACACCAAATTGTGTGCAATCAGTTTTT
GCATCTTTAAAACTATTAATTTTTTATGTTCGCCGTGCGAATTTTTATTTGAATGATTCT
ATTAATAAAGCCTGAAATCCTAGCAATCATTTTGAGCTTCCACATTTGATATTAAAATTC
TCGTATTTGTTGTTATTTATTAATGATTTTGAGTGACTTTTTTAGACTCAGTTTTTGTTT
TGTTTTTCAATTATTCAAGTTCGGATGTGTGGAGATACGGGATTAATACAATGAATGTTC
AATTAAAAACACAAAAGTTTTAATTTGAATTAATGTCGGCGCTGCAGACGAGCCGAGAGC
TTGTCGGATTTAAAATGTAATCCTCCAATTTTGTCTGGCACTGACGGTGTAGATGCAATC
TGAAAATGGCGACTGAGCAGGATCGGGTCGCGGCTGGAGCTCCGGCGGGCTCGGGACGCT
CATAATTCCGCCGGTAATCCCCGTAACGTCGATGAAAGCGAACGCGCCGACAAAAGTGAC
GAAGATTAAGTGTAACAACATGGTTTAAACAAACAGACTGGAGCAGCGGAGACGAGAGAG
AGAGGGAACGTAATCGCCGCGGCCGAAGCGTGACCAAGTCGTTGTATTGTTATAATAGAA
AATCGTTTTATTATGATTTAATGAACGCGCGCTGGCGACTGAAGGATGCTGTATAATTGG
GGGTAATGGGGAAATATCGGGAGAAAAAATATGGCGATCTGCGGGAGAGGATAGTCGCTT
ACATAATCTCTGGAGTTTAGTTGAAGCAGTTCATATTGAGAGAAGCATCCCTCAGACGAG
TAGTTCGTAAA