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  1. Construct 'CONS00001540'

Construct

ID

CONS00001540

Name

p.Cirobu.REG.KhC2.5771334-5773564>H2B::mCherry

Min Promoter

Endogenous Promoter

Reporter

mCherry

Comment

The 2.2kb upstream of Msx (C2.957) TSS drive mCherry expression in the neural plate border, by using H2B:mCherry, a fusion protein for nuclear localisation.

This construct is testing Regulatory Region

REG00001500: Cirobu.REG.KhC2.5771334-5773564|Msx

Sequence

Show sequence

Length: 2,231

CTACGCATTGATGTCGCAATCTCCCCAAGTTTCCCACCACCTATATGAAAGCTACGAAGG
CGGAAAGATTTCGGCATAATAACCTATTGTTGACGTCATAATCGACCGATAAATAAGCGG
CGAAGATCGCGTCCTCTACAATAGGAGGTGGAACACTCATAAAAAATCACAGCGGTAAAG
CCGCTACCACACGCTGCTAACATTTATTAAGGAGACATGCTACACTCGACGTCATAATGC
GCGTGACGACTATATTGTGACGTCACAGAGAGATAAATAGGATATTTATTGCGCGGTAGA
ATAGAACGACGAGCAATAAAATGAAATGAATTTTGGAAATGGTAAATTAATTTATTTTAT
AAGTCGTCTAAACTTTATCCATTTCCGTATAAAACACGACTTTTACCAACTGTTAATTTT
TATTAACTTACCACATAAAGTAGTTTATTGGGCCGCTCTGAACGAATGGAAATCACCGTA
CTCTATTAAGTTGATCGACCTTTTACATTTCAATATGTTAAAAATCGTACATTAAAAAAA
GATATAGTAGGATGGGGGGATGGGATACGTTTTCATTCTATTTTCTTGTCCAATTTGGTA
GTAAAAAAGGAACTTTCAAAGATTTATAAAACCGCATCCTTACGACTTTCATAGACGGAT
GGTAATTGTTTAAAACACGAACAGTATATTAAGATAATATTTTCTAATGGCGTCCCGTCT
TCCCCCGCCCTACTATATTAAAAAGAGGCAATATGAACCAATACTTAAGATTTTAGTTGG
TGCACATCAATTACTGTTTTTATAAGTCCATGCAGACCGATGTCCATTTACCAGTGATTA
AACAGGGCAATAAAATTACGAAGAATCGCCTTGCGTCGCTGCAAACATATTTATTAGGCA
TTAGCAAGTGTGACGTAATAATGCCTCTTGTTCGACGTGACGGCGAGCGCTTGCTTTTGA
AACACCGCGACGTCGACGAAGACGGTGTCGTAACTTAACAATAGTCTGGGGCCTATGATG
TCATAATGCCCATTTGGTGCACTCGCGTGCTGTCGCCCAAAATCGCAATTAACTCGATGA
CACTGGCAGCATATGACGTCATAAAATGGTTGCCAGGGTCCCGGACCGAGACAGTAATTC
ACTTTTATGACCCGAATATCTAATGGGACCCATGATGTACACTTAGAAGCACGCAGCAAC
TGATTATTAATGTTGAGTGTGTTACGGATGACTGTTAATTTCACAAACAAACAAAAAAAC
AGAGTTCGTTGGCCTTTAGATCACTATTAGAAACAACAGTAATTGGTGGGAACTTGTTTC
GGAGCGAGCCAAATAAAAAAGCTAAAACAAACATAACAGTAAAGCTTAATTAAAATAATA
AGCGTTGTTAATAAATATTAGCATATAGACCAAACACCAAATTGTGTGCAATCAGTTTTT
GCATCTTTAAAACTATTAATTTTTTATGTTCGCCGTGCGAATTTTTATTTGAATGATTCT
ATTAATAAAGCCTGAAATCCTAGCAATCATTTTGAGCTTCCACATTTGATATTAAAATTC
TCGTATTTGTTGTTATTTATTAATGATTTTGAGTGACTTTTTTAGACTCAGTTTTTGTTT
TGTTTTTCAATTATTCAAGTTCGGATGTGTGGAGATACGGGATTAATACAATGAATGTTC
AATTAAAAACACAAAAGTTTTAATTTGAATTAATGTCGGCGCTGCAGACGAGCCGAGAGC
TTGTCGGATTTAAAATGTAATCCTCCAATTTTGTCTGGCACTGACGGTGTAGATGCAATC
TGAAAATGGCGACTGAGCAGGATCGGGTCGCGGCTGGAGCTCCGGCGGGCTCGGGACGCT
CATAATTCCGCCGGTAATCCCCGTAACGTCGATGAAAGCGAACGCGCCGACAAAAGTGAC
GAAGATTAAGTGTAACAACATGGTTTAAACAAACAGACTGGAGCAGCGGAGACGAGAGAG
AGAGGGAACGTAATCGCCGCGGCCGAAGCGTGACCAAGTCGTTGTATTGTTATAATAGAA
AATCGTTTTATTATGATTTAATGAACGCGCGCTGGCGACTGAAGGATGCTGTATAATTGG
GGGTAATGGGGAAATATCGGGAGAAAAAATATGGCGATCTGCGGGAGAGGATAGTCGCTT
ACATAATCTCTGGAGTTTAGTTGAAGCAGTTCATATTGAGAGAAGCATCCCTCAGACGAG
TAGTTCGTAAA