- Region 'REG00001563'
Cis-regulatory Region
Name
Cirobu.REG.Kh2012.C1:819143-823896|Nkxtun3
Short name
Cirobu.Nkxtun3-A
Region ID
REG00001563
Status
Curated
Origin
natural region from C. robusta formely Ciona int. type A
Type of Activity
regulatory_region
(complex_region)
Author
Joshua F Coulcher (2023-02-22)
Annotator
Marion Gueroult-Bellone (2023-02-22)
Curator
Marion Gueroult-Bellone (2023-02-22)
819,143823,895
| Motif Name | Binding Factor(s) | Sequence | Position in Region | Comment |
|---|
Aniseed Coordinates: [819,143 / 823,895] on scaffold KhC1
This 4754bp regulatory region is located upstream of Nkxtun3 and is strongly active in dorsal and ventral neurogenic midlines. Genome coordinates are in the article.
Show sequence
Length: 4,753
CGACCAGAAGATTCGCACTACCATTTTTGTCGGGTAAAATCAGATAACGGTCCCTACAAA
TTGCATGTAATAGCTATGACAGGATACGTACTGCCGATATTGGCTTTGTCGCTTCTTCCC
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GATTTTCTATCGCTGGGAATTGTAACAATGCGTGTTTATTACAGTTAAGTGCGACATACA
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