- Region 'REG00001519'
Cis-regulatory Region
Name
Cirobu.REG.KhC6:403003-407293|Onecut
Short name
Onecut -4.2kb/+105bp (Stolfi and Levine 2011)
Region ID
REG00001519
Status
Curated
Origin
natural region from C. robusta formely Ciona int. type A
Type of Activity
regulatory_region
(complex_region)
Author
Alberto Stolfi (2020-11-21)
Annotator
Marion Gueroult-Bellone (2020-11-21)
Curator
Marion Gueroult-Bellone (2020-11-21)
403,003407,292
| Motif Name | Binding Factor(s) | Sequence | Position in Region | Comment |
|---|
Aniseed Coordinates: [403,003 / 407,292] on scaffold KhC6
This 4.3kb cis-regulatory region spans from -4.2kb upstream to 105bp downstream of Onecut transcription start site. It recapitulates Onecut WT expression. It was cloned using the following primers : Onecut −4.2 kb F: TCGTTCGTCGTCTAACAGACG; Onecut +105 R, CATAGTGATGAAGTCCGTTGC.
Show sequence
Length: 4,290
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