- Region 'REG00001502'
Cis-regulatory Region
Name
Cirobu.REG.KhC5.2824518-2829361|Fgf8/17/18
Short name
n/a
Region ID
REG00001502
Status
Curated
Origin
natural region from C. robusta formely Ciona int. type A
Type of Activity
regulatory_region
(extended_promoter)
Author
Imai team (2019-03-18)
Annotator
Marion Gueroult-Bellone (2019-03-18)
Curator
Marion Gueroult-Bellone (2019-03-18)
CONS00001543: p.Cirobu.REG.KhC5.2824518-2829361>NLS::LacZ
CONS00001544: p.Cirobu.REG.KhC5.2824518-2829361>H2B::mCherry
CONS00001579: p.Cirobu.REG.KhC5.2824518-2829361>H2B::CFP
CONS00001580: p.Cirobu.REG.KhC5.2824518-2829361>unc76::mCherry
2,824,5182,829,361
Motif Name | Binding Factor(s) | Sequence | Position in Region | Comment |
---|
Aniseed Coordinates: [2,824,518 / 2,829,361] on scaffold KhC5
This cis-regulatory module is active in A9.30 lineage including motor neurons.
ggagggtcgcattttcgtatgtaatccaagagaagaataatgtcccttagaaatcacttt
gatattcggatttactatttatactcgcaatgcattaaatccgaattgacattatttaac
tacttactgaataaatatacaaagcataaagtttaaatttatttctgctttcactttgct
attatcctgaacaacttataacaattctaacatcgactccgaataaaattatctgccgga
tcctaaagctcggtttcccgctgtgcagcatgtccttcccgagggtcggcgcgtggcgct
ccataccgctaaaatctaagcacacgactgggttgttattttgtccattaccagacgagt
aaaaataacgaaccgcccagcgatcggcatcgtttaatgtaaataacggtaggcaacgcg
cttttaacaaacgcgttgctggagccgcgggaaaaaagcgacggtgagaaaaagtccgcc
gatttttgatgaacacatatcgaacttgtgctggctacagcttacggtgttttgggcaca
aaattaatggttttcttctgcatttaaaaaaactttcagggtgattggattgttctaacc
cacacaacaacaatttgcagaattccaagcacgaacgagggtaaacaaaccaattagcaa
aatctgcgcattcttttcatacgttggtattcgtaattgactgaaattgcactcgtgtat
ttagcagagaccaacaaaacgaaacacacatccctttacaaccatacagcttcccaacaa
aacaggtttgtgtttttccacaggtgctattatgtcgtaacatagaggaagagattaaaa
accgttttgttacgtcataatccccaaaacgctcatgccgcccgtcgagcaaacgcgtag
caaattaaaggtaactgtataaaacgtgggcaaaggaaaataagtgggaaaagacaaaat
aaaccgcgccaggggagcaattaatataattcgtcataggagagtcctaatttttaaaaa
aaacttccgatacgggaaaagttacaacgtgtgtagtaactatgacacgtatgcctattg
aactcaagataaaagtgttttaaactggcgcaatagcgaaatatgtcacgctgttaagtg
tgtttggagtacgtgtggttcatatatagtatagggtggggaaagatgggacacctattc
attctattttcttgtcctattcggtagtaaacaaagaatattcaaaaattataagaccgt
tttctcgcgaatcccatataccgttgttaattgtttaaaacacgatcagaatagtttgat
agtatgtcccaacagggcccgtctttccgcacacttctttatacaacagtttagcattca
atgaattccgctgtaaatttatacgaagataaaaataaaactgcgacagtttgaaacggc
gcttgttcaacacatccgtgaaatcgagcggtttatcagatctgatgtaaagaattacaa
tttctctgacgtctgcctttaaaaataaacccaggacaatttcgaatattgcggcacgat
tacacaattcaggcaaaaggcgccgggtgtcataatattcacagaatatcaagttgcggg
ttatgttatcgacaattggaaggtgtcaaagcgacagaggtattaacggccgtcatacat
gtaatagggtgtccgttttcattgcgaccgtcgctgaaatatcttatcgtgcggttggcg
cctccagtgacaaagcaacgcttatgcagttacagtcacgtaaacttgtttcgtttgtga
aatattgcgcttacatcgtatcattatgccaggaatgttttagaaatggttcccagcccc
actcggccgacgtcacagcacgaaataattccctattgttacgttcgttttcgacccgct
gatcagaggtcgtatctattcggccttgaaccgagaggcccccccgcaactaattacaag
gctattgttcagcacaaaaactttcctacaataacgtctgtcaaggtgacagcgtgataa
agcgtatatttgtacagaaagtagaactgcagtagcccactaattgtttcactttacaaa
ccttcgcagcagacggctctatttcgtaattttaagcaaacattaatatcgaagttaaaa
atatcttattacaaatcaatcacaatcaccaaaaaatggatatttaaaaaaaaaaactta
aacaaaaaattataaactataataatattcttgggtatttattctaagtttagtgaaacc
gcaaaaaataactgtttctaaaacctccgaattaaccggttttacccttggcttaggcct
gagtgattttaatcgctacacttgtttgtttagcaaaaatatataaagcaagccggtaca
cgagcttaatcatattacgcaactattctcaactaatatctaccctttactccaacctag
cgggcaaagctgaatattattattgatattggtatcttggctacaaaagtacaatctcac
tatacgttgtcgcaggaagtgaacagtcgtgggacagaagcacttcacacgattttgctt
aacaaggaaaattaaattctcgctaagccgccacttgccctaattcccggcctatgatag
cgggctgttgtagggccgcttcaagcaccaaacaccgagagggctattgttgtcgcgacc
aactttacacaacgccgaaaattttgctgtatgtatgtacagaccgcaggcacgcttatt
gtgctttaaaaactctccgtctttcgcggcgctactgtattcatatactgcaaccttggc
aaagtgttcggcgctgctgcaatgcgaagcgccgcgttttctgcgctttgctctgtggcc
aagctgcccacacaatcgaaactgcttagaaattagcgccgtcacctcaagtgcccgtaa
ggggctcaacaaatgtgattggattgatggaaaaagcgctgtcgcttgtagcgtgcagtc
gagtctgccttccttaacactagaactacagaggcccaaataaacagctgtatacatact
tgctgagggctcggcaactaacatcagaacgtttaaactgtgcactagccgaggctgata
aacatccgatcgcaatcgtatggcgctcactaaggactaaaactcccttgtttacataca
actttatattacatgtgctctctgattctgtgcgtcacgctctctgtgtgcgataagcgt
ttcctataaaacaagttgatgtaattaaccagcagtcaatggacggcaggcaggcgaaca
acgtacttgaggaatgggaaagcggtatctcagacacgcgttgtatttcccattatcgga
ggctaaacaatgagaatagctgggccggcatttttcacaacactacctctgggagaagcg
gggtttccggacaccgacgccgactcttgaaagcgagatacacccagccgtttaaacatc
gactgctttagtaacagaatatgatttactgttttaactgctacactgcttcgtaaaaag
gtattacgaatcttttccgcacattacttgtttgctcataatcgattttctgaaatcaaa
cttcaaaattaatagtaatcctttcggaaaacatgctcctgcatatacacagctcgttgc
tggatgacatgctaatcacaatatcatgataccttttttaattgtcatttttagttggga
atagttaggagaaacgtaaactgaacccgacttcgcttatttttgacggataatccggcc
cgggtaaccgcagtaacctcaagaatttcgaggtattgagttcgcaacagtgttaacttt
taccgatccgggtttttggctaaggccgttgatcgtagattagacagccgcgtgattcat
gaaaacgccgtgcaggcaggagccgccggaacaatgcgctaccccgagagtgcagtcacg
tttttttgcgagaaattgcggactgatattttgcaagcaccgcgtacttgtatgtcaatg
cggcctcagcggcccttgccctgtttaggctggcgggattataaatttgcacaaacaccg
acgaggtcaagtcgctagagccgatacacagcctatttgtgtaccctgtgctagcggtac
tggatagttggaatatttgggaaactgaaaactgatgatctgaaattcgagatcattaaa
ccagcgcaatctgacgctttgttgtggacaagactcagaacaaagggagacaagcccgat
ttgttttcagtccagtaaactgaggttgcgagataagaatagaataccggtgctatatat
atacacataacttattcattattggtaaaccacgacttttctgtacatgtacgtttggtg
tattgctttttataacgcttaaacttaggtatgtttattgtaacaacaaacgctagcata
ttacagcattccatggggttctctcaacgcaccgaattagcatcggaaaaataccaaaca
gcagtttcacagaaattttcgcttgaacaccttgcgttcaacagctttagatctgtgacc
tttgcattttcggttcaaaccaggcatatacctatagtccatcattataccgcgtttttc
atatttattccacattttttaatgtctatgtccatacttaccggcaaaacaatacggagc
agatgttatcaaatgcggtttgattttatcataatttatctgatcagaagcggctttagc
agcaatattttaacctacgacaaacgtcttgattgcactgattgctggagctctgtttgt
tttaattaaacccgcccacttcacgaggtggcttaaatctatgc