- Region 'REG00001501'
Cis-regulatory Region
Name
Cirobu.REG.KhC1.9619886-9623328|Asic
Short name
n/a
Region ID
REG00001501
Status
Curated
Origin
natural region from C. robusta formely Ciona int. type A
Type of Activity
regulatory_region
(complex_region)
Author
Tatjana Coric (2019-03-18)
Annotator
Marion Gueroult-Bellone (2019-03-18)
Curator
Marion Gueroult-Bellone (2019-03-18)
9,619,8869,623,328
| Motif Name | Binding Factor(s) | Sequence | Position in Region | Comment |
|---|
Aniseed Coordinates: [9,619,886 / 9,623,328] on scaffold KhC1
This ASIC (KH.C1.215) cis-regulatory module is active in the sensory vesicle and visceral ganglion in the trunk and in bipolar neurons of the tail. Author's information : The 5-kb region upstream of exon 5 of CiASIC (promoter/enhancer of CiASICa) was amplified using the following primers: CCTGTGATGACGTAACGCTTAGTGACG (sense) and GCTAGGATCCGCACTGTTACGTGTCACAGAGC (reverse)
Show sequence
Length: 3,443
AAAATGCACTGTTACGTGTCACAGAGCAGGTAAACCCCCTAAACCAATGCGAACTTTGTA
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