- Region 'REG00001488'
Cis-regulatory Region
Name
Cirobu.REG.KH2012.L152:99298-106485|Islet
Short name
Islet -7216/+1 (Stolfi 2010)
Region ID
REG00001488
Status
Curated
Origin
natural region from C. robusta formely Ciona int. type A
Type of Activity
regulatory_region
(complex_region)
Author
Alberto Stolfi (2019-02-26)
Annotator
Marion Gueroult-Bellone (2019-02-26)
Curator
Marion Gueroult-Bellone (2019-02-26)
- Cirobu.REG.KH2012.L152:99298-106485|Islet REG00001488 [ regulatory_region (complex_region) ]
- Cirobu.REG.KH2012.L152:102537-106485|Islet REG00001489 [ regulatory_region (enhancer) ]
- Cirobu.REG.KH2012.L152:99298-102536|Islet REG00001490 [ regulatory_region (complex_region) ]
- Cirobu.REG.KH2012.L152:101452-102530|Islet REG00001491 [ regulatory_region (complex_region) ]
- Cirobu.REG.KH2012.L152:100246-101451|Islet REG00001492 [ regulatory_region (complex_region) ]
- Cirobu.REG.KH2012.L152:101110-101528|Islet REG00001494 [ regulatory_region (enhancer) ]
- Cirobu.REG.KH2012.L152:99299-100379|Islet REG00001495 [ inactive_region ]
CONS00001651: p.Cirobu.REG.KH2012.L152:99298-106485>unc76::GFP
99,298106,485
| Motif Name | Binding Factor(s) | Sequence | Position in Region | Comment |
|---|
Aniseed Coordinates: [99,298 / 106,485] on scaffold KhL152
The 7.2kb upstream of Islet (KH:L152.2) TSS drive strong reporter expression in atrial siphon muscle precursors, notochord, bipolar tail neurons and cholinergic neurons of the central nervous system. This Islet cis-regulatory DNA fragment was isolated by PCR on genomic DNA.
Show sequence
Length: 7,188
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