- Region 'REG00001266'
Cis-regulatory Region
Name
Cirobu.REG.KH2012.L24:33143-35824|Ebf/COE
Short name
COE/Ebf -2.6kb/+8pb
Region ID
REG00001266
Status
Curated
Origin
natural region from C. robusta formely Ciona int. type A
Type of Activity
regulatory_region
(extended_promoter)
33,14335,824
| Motif Name | Binding Factor(s) | Sequence | Position in Region | Comment |
|---|
Aniseed Coordinates: [33,143 / 35,824] on scaffold KhL24
A 2.6 kb genomic DNA segment located upstream of the Coe gene directs expression in all of the differentiating visceral ganglion neural precursors.
Show sequence
Length: 2,682
tcccgccattgttgccatttggatattacttacaaataaaataacacttaaggtatctgg
tgaaaaatcacgttagggtaaaaaaataagtcatctttttatagttttcaattttataca
ttttattaaaacgtggatttttttatttaggataatttttaagaaataaagaacttgttt
tgggcatttttttagaataaaggaattttttaaattgaacaaaatgacttttctgaaata
aaattttatggaaataaaaacatcgttttctctataccaatatcattaggatgaataaag
gaaataataaaattattgttttaaataaaaatttaaactgaaataaataattctagttta
ttacagatagttacagattttaaaaacatttaattttaattatagaatgcctaaatggtt
agtttctcaatgaaaagcaaaatggcgtcgtttatcggtttgcgtttaagagttacaatt
aacggaatcaatttacttcgaaaatctttttgccctttcaaaaggtaaattaactttaac
tcctgactgtcaccttgattaataactaacattgcaaattagtcgaaatcccggtcggga
agctatctccaactcaatctatttgcgaaatccgcagagacgatctagctgattctacac
tgtatggtggccaactagcgcgctgggacccggcccatgggtcgtccgggacgaatccac
caagttagtggcgaatcgtccgagttgtccactgagagaagtctctgtattgatgtgtcc
gttgagacactggcttgctggttttaaactccacgacgcgtggccttctatactctagta
ttcctgactaggacagaaagaaaaaaggcggcgcatgtcttggagtaaggttctttttcc
tccgtgccctcgcgactggttcctgtctcataaatcggagcgtgcatctgtcgactttcg
cctcattctctctttcgctacgaaacgcgtatgccacccctatttacaaacaccattgcc
ggcgctgattccaaaatcgtgtttttcgcattcacgcagattactttttcctccgcttaa
caacaggcaaatttacgtttttaaaatatggcacacatattgagaaaagcacaaaaatta
aaagctagaaagtaaattacattttaaaaaattgtacgtaatttttgcttcagatatttt
ggttagttattctatgtaaaacgtacaattattttttttcaagatttcaaaaaaattcaa
atatcaaaatacgaaactctgtccgccatttaaaacttgggcctatacttaaacacgtaa
cctaacgaaaaagaattgtacagcctttggaaataatttcgttggtttcgcgattttcaa
aaggttaacaaacatttttcaaaaaatagtacaaaaacgcgcagagataaaatggataca
ttttatataaaacaaaatttgtgccgcgctaaatcaaatgattaaacagagaaataatta
aaaacaaacaatccttcgttgttctaatcgtatccgggcgtgacgagagcgcttgtgacg
tcacaatagcaataaaattcgccgccttttagcgtcgcaagaaagttgtgaagtaattac
aacgtttgctaatttgtttgttttaaaggtgataactgtagtttaaaaaaaacaaaataa
ttttacattttttttataaattttaggcagttttgtggcctttgtcggcttaaattgttc
agcgactctaagtattattttttaacatttttttcgaaattctaattttgaataccgttc
tcttgtttgtttttacgttttttatgggttatttatttgttattttatgcttgtcctaac
ttcttccgtcgtaaaaattaacattcggcaaaaagtgcaatgctttgaattttccaactc
gaaggcacgcgacctcgtctctgtgacgtcactgtgcactgctttgtgacgtaggcgaga
cagcagtgacgacaatgcctcgtttacgacttcacaatggacagagccgcaaagttgcta
agacagaacgaagattcgtcgaacagatgtggcgacgcgatcggacttaaaaaacaaaga
gggaaattaacccaaacaaaagggttgcgtgttgcaactctgtcgaccatatttcagacg
cgcgcatgtgattgtgacgtcacggagtatcgatcttggccagcgaagagaacgcgttgt
tagaactcgcgcggagtaatatccatatgagaaattggttttatgcgcaagttaaccgtt
tgatttatcaaacggtaaaattgaatacagcggactaaacaaatgacatttttaagccat
ggcgactaaaaagattaatatttatcacaaaaatgtaaaatttgcaattttaatccagtt
tgatcaaaatttaagttatttctaaaaaatatttaaaaatctggtaaaaattgtgataaa
taaaaagactgatcttttttgcaatggtaacttatatagctgctaaaattgtcgtgaagc
aacgtcacatatttcctaaaccaggtcaccgttatagggtggagtgtggggtatcgaata
tcatggaaatttgaaattcgaataaagtcgctgccgctcttatttcccggaagaattcat
taaactttgccagagacttttccctgcagacaaataatggac
