- Region 'REG00001208'
Cis-regulatory Region
Name
Cirobu.REG.KH2012.C1:3004954-3007753|Arrestin
Short name
Arrestin 3kbp upstream
Region ID
REG00001208
Status
Curated
Origin
natural region from C. robusta formely Ciona int. type A
Type of Activity
regulatory_region
(extended_promoter)
Author
Reiko Yoshida (2017-06-25)
Annotator
Marion Gueroult-Bellone (2017-06-25)
Curator
Delphine Dauga (2017-08-29)
CONS00001211: p.Cirobu.REG.KH2012.C1:3004954-3007753>H2B:CFP
3,004,9543,007,753
| Motif Name | Binding Factor(s) | Sequence | Position in Region | Comment |
|---|
Aniseed Coordinates: [3,004,954 / 3,007,753] on scaffold KhC1
The cis-regulatory region of Arrestin corresponds to 2965 bp of its 5’ flanking region, including 5’ UTR. Ci-arr Upstream Region Recapitulates the Endogenous Ci-arr Expression Pattern, in the photoreceptor cells of the ocellus,
Show sequence
Length: 2,800
cagccatgctttaagaagttagacagagtacaaactcaaacacagtgttagctaattgca
aatcggaactaacggagtctgtcatgtgaataatgtatgaacggggtgattatattttaa
acaaaattaaatgtcctaaatttcttactaaataaattaacctatatatacatcctatat
caaatgttttttaccatttgaaatgcattttaactggtaatattaaataaaattgctctt
tttcctagttagagttatagaatcatctataaaaagaccatgttatgcgaatgcctaaaa
tgctatttattgaattaaattgtttctataatatacatacatatatattttaaacatatt
tactcaaaaattaaattaaatatatatatatatatatatatataatatacagcattttaa
agcaaatggtaaatgctaattactttccttgaatattacctaaaataacattaaagttta
aaggaatggaaaaatactaaccctaaaacatgtacacgcaaatataaacataaaacggca
aattcttacagctaatttagtgctaaaccataaatacacataaccacatttcatagtgaa
actaagtcacaattcatagcccgttacttattaaagctagataggatatgatgtcacacc
tagcttcctttttagagatgaagctttagtaggaaagcaaaaatcatttattttcggtta
tgtaactgtaactgcaaccaaaacaatcggacagccttaaaaaaaagacattgtaaactt
atgcaataggctattaactttatttttagaacctttattttttgaatgcaaacgcgtcaa
agctacagattgcaacagctttaagctaaatggtctaaattaaaacgtttttaatttata
caaaacgcaactgtgataaattatttactataaatctaacaacgaactaaaaatacgata
attataaacttacaaagcaacactaatttgcaaaaaatctgtctcatctgttaagaagat
ataaaaaaacggtaatatgagaaatccatgcgtttatgaatggaatacataaagccttac
aacgaaatcatttaatacaaacagaacactttgtagcttaaaacaccgggagtaaacgta
ccaaacactaatcgctagatgacgctaagctatgtccaaataaagcagacatttgaggcg
gcagaaccaaatacaccacggggtaatgtctaaagataggtcttcctatataaaaacaac
gagaataaccacgaaaaccacaattataatccctgtataacatacaatccagcaaagaat
gaaattttggctcagcattgtcgctcttataagccaaccaacccaatcagctaatagggg
attacaaattccatacatgataaaaccttggcgcttgaaccaaaatttgctcagtgatca
cttaaagagcaattttatggaaaggatcaattttaattcaggacacttcagcaaaaagga
gatttatgaacgtaaatccgctgtccacggtgtcttttaggataaaattattgttgcgtg
aaagccttgtattggaattcaatatgttcaatggatgcacaatatgtttatccaccggaa
aagtacaagggtcggtaaatagaatcgccatgtgtttaaagtataacattttttagcagt
agcagcttatgcccacttcaacgatattcattatagagtagggtggggagagatgggaca
ccttttaactctgttttcttgtcccatttagtagtaaacaaagaacattaaaggaaatat
aaaactatatcaccacgactttcaaggaccgttgttaattaattaaaacacgatcaggat
ttttggataatatgtgctaaaagtgtcccatcttttcccaccccattataatctttcaac
aagatttgtgaccttaggtttttgcatgacttattttttactacgctccgaccaacactc
tttaatatactgtagatagtatagttgggtgggaaagatgggacactttttcattttatt
ttctcgtcacatttggtagtaaacaaagaacattcaaagaattataaaatcttgtcttca
cgactcccatagaccgttgttaatggtttaaaacacaaacgagataactggatataatgt
gttaaaggtgtcccatcttctcccacagtactatgtataatgtaaatagtagggtgggaa
aagatgggacatatttagcactttatatgcgcaaaatatctctaccattataaatgtgtg
ttttagggcaagtaatttattaaaactattcacccataaagttaaaattatgtaataact
cgtaagtgggcacggtgtacgaaacagatcctctgccatatcataactgttaccaagcgt
tgataaaagttacatttctaaatccaactagatatgaaataataataagactgattggtg
aactgtttattccaaaaaacagcagattaataaaacacataatatactgataacgtttga
aaaacgaaactatatctggcagcattaaccatatagaatggtcaggcatatgacagtgtg
tgaaacaaactgctccgaactgatttatatcattatatttaacatagaaaacacgatttt
gatttatctatgttttgttttaatctttttctttcccttctgcttttgagcttttctgca
gttcggacaaaaccattcttcattttcaggcggttcttgtatgatgccaacgcacggcct
gtaaagttataaaaaatgatagacataaagtgtatgaaac
