- Region 'REG00001201'
Cis-regulatory Region
Name
Cirobu.REG.KH2012.C2:2426727-2430527|CNGA
Short name
CNGA 3.8kb upstream
Region ID
REG00001201
Status
Curated
Origin
natural region from C. robusta formely Ciona int. type A
Type of Activity
regulatory_region
(extended_promoter)
Author
Philip Barron Abitua (2017-05-05)
Annotator
Marion Gueroult-Bellone (2017-05-05)
Curator
Delphine Dauga (2017-08-29)
CONS00001185: p.Cirobu.REG.KH2012.C2:2426727-2430527>mCherry
2,426,7272,430,527
| Motif Name | Binding Factor(s) | Sequence | Position in Region | Comment |
|---|
Aniseed Coordinates: [2,426,727 / 2,430,527] on scaffold KhC2
The CNGA enhancer was amplified from Ciona intestinalis genomic DNA using the following primers(KH.C2.249; 59-GTGGAGATGCCGATTTCAACC-39 and 59-CACTTTGTTTGGCATTATTCC-39); it drives expression in fully differentiated aATEN-GnRH neurons.
Show sequence
Length: 3,801
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