- Region 'REG00001198'
Cis-regulatory Region
Name
Cirobu.REG.KH2012.C3:1281230-1285516|Six1/2
Short name
Six1/2 4.3kb upstream
Region ID
REG00001198
Status
Curated
Origin
natural region from C. robusta formely Ciona int. type A
Type of Activity
regulatory_region
(extended_promoter)
Author
Philip Barron Abitua (2017-05-05)
Annotator
Marion Gueroult-Bellone (2017-05-05)
Curator
Delphine Dauga (2017-08-29)
CONS00001198: p.Cirobu.REG.KH2012.C3:1281230-1285516>GFP
CONS00001180: p.Cirobu.REG.KH2012.C3:1281230-1285516>mCherry
1,281,2301,285,516
| Motif Name | Binding Factor(s) | Sequence | Position in Region | Comment |
|---|
Aniseed Coordinates: [1,281,230 / 1,285,516] on scaffold KhC3
The Six1/2 enhancer was amplified from Ciona intestinalis genomic DNA using the following primers (KH.C3.553; 59-GTGACAGGAAACGTCTAGG-39 and 59-TGGCTCTGAGGCCGTGATTGTAG-39); it initially drives expression in a row of eight cells located immediatly anterior to the neural plate.
Show sequence
Length: 4,287
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