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CIS-REGULATION

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  1. Region 'REG00000867'

Cis-regulatory Region

Name

Ci-vAChTP -4660/106

Short name

n/a

Region ID

REG00000867

Status

Curated

Origin

natural region from C. robusta formely Ciona int. type A

Type of Activity

regulatory_region
(extended_promoter)

Author

Katsumi Takamura (2010-07-21)

Annotator

Clara Degos (2011-08-16)

Curator

Delphine Dauga (2011-08-16)


Description



Coordinates are based on JGI transcript model.

Construct(s) made to test this region

CONS00000831: pCi-vAChTP -4660/106::EGFP

Overview of functional TF binding sites in this region

4,530,7564,535,521

Motif Name Binding Factor(s) Sequence Position in Region Comment

Sequence

Aniseed Coordinates: [4,530,756 / 4,535,521] on scaffold KhC1

This sequence was found thanks to the primers used in the paper.

Show sequence

Length: 4,766

GCAGCGCTGTTATACCGGCAATCGTAAAAATGTGGCGGAATAAACTGTATATACTCAAAG
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