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CIS-REGULATION

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  1. Region 'REG00000711'

Cis-regulatory Region

Name

Ci-Hox10 -5000/1

Short name

n/a

Region ID

REG00000711

Status

Curated

Origin

natural region from C. robusta formely Ciona int. type A

Type of Activity

regulatory_region
(extended_promoter)

Author

Tetsuro Ikuta (2010-06-09)

Annotator

Clara Degos (2010-06-18)

Curator

Delphine Dauga (2011-02-25)


Description

Region of 5 kb of DNA from upstream of Ci-Hox10. In normal development Hox10 was expressed in dorsal cells of the anterior nerve cord at tailbud stage.

Construct(s) made to test this region

CONS00000679: pCi-Hox10 -5000/1::LacZ

Overview of functional TF binding sites in this region

102,881107,880

Motif Name Binding Factor(s) Sequence Position in Region Comment

Sequence

Aniseed Coordinates: [102,881 / 107,880] on scaffold KhL132

Sequence from JGI V1.0. Coordinates based on the +1 of the KH model.

Show sequence

Length: 5,000

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