- Region 'REG00000709'
Cis-regulatory Region
Name
Ci-PDE9 -4412/6333
Short name
n/a
Region ID
REG00000709
Status
Curated
Origin
natural region from C. robusta formely Ciona int. type A
Type of Activity
no_output
Author
Delphine Dauga (2010-06-08)
Annotator
Delphine Dauga (2010-06-08)
Curator
Delphine Dauga (2010-06-08)
Root region, untested.
5,957,5935,968,336
Motif Name | Binding Factor(s) | Sequence | Position in Region | Comment |
---|
Aniseed Coordinates: [5,957,593 / 5,968,336] on scaffold KhC9
Sequence from JGI V1.0
AAATTCATGGCTGATATACCCGGTTGCTTCGCCACAAACATGTGTGTGTCTCGTGCGGTT
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GCCATCTCGTTTTCGGGTGAGCGCCCATAGTACGTCATTCGGAATTTGGTAGCTTTTCCA
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GAAAGTTTGAATTATAAATCTAAACTATATACAGATTCTACAACAGCATAGGGTAAGATA
TTGATTTGCGTGATCTGACATTAAAAGAAACAGAAACGAATTTTCAAATCCAAATCAATT
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TCCGTCTCGAGATGACAACCTGTCAGAAACATCAAGCTCTAGGGAAGAGGCTGAGCTAGA
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GCAAAGCAATGGAGCTCCAGACATTGGCAATGAGTAAGTGTTAACGTTGTATGTTTTAAA
TCATCTTTTAACGGCTTATCTTGCATGAAAATACTCAGTGTATATTTCCTACGTTTCGTC
CGCCATCCCGCAATACTCAAGGTTTATGTTTTATAACGTTGAGGTTTACCGCTTCATGCA
TGCAATGTGTACGGAAGTTGACGCGTTTGAATTACGCGCTGTAACGTTGGGTTTAACGGA
GTGCATTATATAAGGCTTAGTGGTAATTCAAATGGGTTCAATTCCAAAAAAGGAGGTACG
TTCTGGCATGTTGTGTGGTCGTGGTGTTTTTCATACGTTTTTAAACATGGACTTTTTATG
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GCAACGCAAGATGGTGACAGAGATTTGAAACCACGATATTTGAACAATGTTTCAATGAAC
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AAATTGGTGGGTGTCGTCATTTACGGCATAATTGGGAGGCGCGATTAATCGTTCGTGACG
TCAAATTGAATTAAGTTGTCAGGGCGGCGCTTATCTCGCACTTGCACGGCTGCAAATTGC
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ATCACACTTCGACCATGAATGGTTGCATAAGAAACATCAAAGGAGGTTTACAAGTTCAAC
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TCTACGGAAGCCGCAGTAACGATAGGCTTCGAATCCGTCCCCCGCACAAGTGGAACGAAT
TAAGATTGCCATAAAAAGTGACAGTGCTCATCGGCGGGCTATGCATTTCTCGTATTTATT
ACGCAACGCGTCGACTTTCTTGGAAACAACACATCCTGTCGAACCTTCCTACGTCATACA
TTGACGCCTCGTAATATTGGGCTGTGGGAAATGATTTGCGTCTGACGTCGCTACAACCGT
TCATTTTGTGTTACCCGTTCCGGTCAGGAGTATTTCGGGTTTTGATTAAAAACAGGTTGG
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GAAAGAGACGCGGTCAGGATCCGGCGCGCGCCTCAAAGCGCCAGGCGCGAACTGTTACTA
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CTACGACCTATAGGGGATGAACTCGCTATAATGTTGCAGCTTAAATTATTTGACTGTAAG
CGCTGGCGCTCGTTATAGGCTCGGATGTTTGAGCTGTTATGCTTTCCTTGGTTTAACAAC
GCGATGCCGGAACCAAAGTTGCTCTTGCGATTTAAAGCGCTATTAATCACGGTCTTAGTC
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