- Region 'REG00000630'
Cis-regulatory Region
Name
Ci-PC2 -2786/98
Short name
n/a
Region ID
REG00000630
Status
Curated
Origin
natural region from C. robusta formely Ciona int. type A
Type of Activity
no_output
Author
Delphine Dauga (2010-01-15)
Annotator
Delphine Dauga (2010-01-15)
Curator
Delphine Dauga (2010-02-26)
Region not tested.
230,968233,851
| Motif Name | Binding Factor(s) | Sequence | Position in Region | Comment |
|---|
Aniseed Coordinates: [230,968 / 233,851] on scaffold KhL128
Sequence from JGI V1.0.
Show sequence
Length: 2,884
GCCATTCAAATAAAATGCTGCTTTAAGAATTCTTCGTTTTTTCACCGTGTTTTTAATTAA
TTTAAATTACAATAAAACAGCTTAACCGTTAACGTCCCTGTAAGATAATGAATTTATTTG
TAAACGGAAATGTATAAAACTGCGCACCTAATACCCTTTTAACTTACGACAGTCGACCTA
GGTTCTAACCGATGTTCGTTCTAACCGTCGCTTCACCCTAAGAGTGATACACCAGGTTAT
ACAAGCTCTTCTCTGTGAGAATTTATAAATAACCATCGCATATCTTGGGCCGTCTTACGT
ACGCTGTACCTAATCGATAAATAACCGCAGAAAAAAATCCATTTCCTCTCAGTATTTTCC
AATGACGTCAATATTATGACGTAGAAATTCTATATCTAAGCTTCCGAGTAAACATAATTG
ATCCGTAAAGCTTCGCCCTTTTTACTGCGGTTAACGATAAATACGCCCCTTTTATATCTA
ATAACTGATACAATTCTACAACTGTAATACATTATGTCAGCTGGCGCAGTAACACTATTA
CAATATTTGCAGCCTAAACCTTTTACATTTTTTTATCAGTTAAATAAAACGCCTTTCACG
TGACACTTCTTGCGCTGTTATACCCCTAACATATGCCACGTTCGTAATTATAAAGATATT
CCAGATATACCGTTCTATGTGCGACTGTAATACATTATAGTACCAGCTGTTACAGTATTT
ACTATCCAATACATACACGTGCGACATTGTCTTACAATCCAATTCCTATACCGTACCCTT
TTATCGAACAATTTTCGCTTACCGCTTTCCCAATTATAAACACATTGAGATATACCTTCT
ATAAGATATCCGATAAAACTTTTCTTATTCTTTTCTGCCCTACCGCGTACGTTTCACAAT
ATCAGTGTTGCTCCGGTAAGCTTAATTACGTCCCTGCCCGCTTATGTATTATTCATACAC
AAAAACTAGCCATGCGTGACGGCCTGTCGTTGCTGGTATTGTGACGTAAAATGACAATCA
AAAAAGGATTAGAATACGTTCGATAGGATAGGGAATTTAAAACACTATTGATTATCTGGC
ACAGATGTATAAGATGTTTGCACCGTGGCCTATCGAATGTGTTTAGAATACATTCATGTG
TGTGATAATACACAAACAGAGATCTATCTTCGCTACATTTATAGTACTTTGTGGCAAGAT
GGAATACAGTTAGCACCCAAATCCCATATTTTTTAAATCGTGTATTTAACAATTACCAGC
GCTCTTTAGAGCCACGATTATATGAATTCCATCTTACCTTAACCTACTATATTGGATTTA
TTTAACGCCAGTTATGACCCGACTGTTCTTAATCCATATCGACAGCTCCTTTAACTTCAT
AGTAGGCTATAGGTACGCATAAGACAGTGTATGTTTTTTTCTTTATCGCCACATATGGTA
ATAAGTCAAAAATATTTACACAAAAATAACCGCATTCTCAAGATTATGAAACAGCTTTGT
TGATTTTTAAAAGCACGATTATGCAATATTACGTGATCATGGTATCCATCTTTCCTCACA
GTACTATAGTTTTTACCTCTTAGCCAGTAACCCCTAGCCCTAATCCTTCACTTTCCTATT
CTATCGACTTTTAATTACCTTTAGTAGGTTAAAACTATTGTAGGTGTATGTGTCATTGAT
CAAGACACAGATAGAACTTTGCTGAAAACCAGTGATACCTTAGGAGTAGTCAGCGTTATA
TCCTTGTACTGCCAGGCGTTTTTTTGCAAAACGAGGAACAAGTCTATTTTAAAGATTTAA
TATCGTGGTGTTACTTACGCGTGTATGACCTAATAATGAAATACTGAAATGCACGATTGT
AAATCAAAATGCGTAAACAAATAGCAGGTTAAAAAAACAGAATAATTTTAAGCGCAACCG
TTAGCGCCGATTAGCGGTAGTAATATATGCTTACAGTCGGTCAGAAGAGGGCGGTATAAA
ACGTTTGGTCATGTATATATCGACGTCGGTTCATTTATATCATATTTGGCTTAAGTTATT
GCATAAAAGTTGTTATTTTGGCCAAACTAAACTATTGTAAAAAAGATTGTTGGTATTGAA
CACACTGAAAACAAAAAGGAAATTATAAACAAAAGTATAGGAAAGATAATATTATTGCAA
AATTGACGTATTCAGGCGTGTTAGTAAATGCATTTATGAAAAAAATGATAATGCTAAAGG
GCATAACAAAACATACAGAATCGGGCATAAGGCTTAACAACAATATTTTTTATGGTGCTT
CTCAACGATTTAGCTGTAACCAAAAAATAAAACATAAATTAACAGCAAAATGACAACCCA
AATTCTAAATCTACATTTCTCACAACTTTTTTTAAGCATTCAACAAAAAAGTTTAACTTT
TACAAACACAGTCAAATGCCTTATGAACTACCATAGTCACTAAACTGTGACCCCTTTTTT
GGGTCACAAACCAAAGGTTGAGAAGCACTTAATTAGAGAATTTTGTTTCAGGTGTTATAT
TGTTGTAAAATAAGAATCCGAATTTTATTCATTACTATAAAATAAATTGAGGTCTTTGAA
AACAACATTCCATGGGTTAGTTAAAGGTTTAACAACCAATCTTATTTGCTACTGCATAAC
TAAGAAAAAATAAAGTAACACAACAGTAACCTAAACCTTAAATTACATAATTTCATTTGA
TTTAAACGAGAAATATTCTAAGACTACACCGCCAATAATACAATTGCCTACAACGCAATA
ACAACCCACTGTAGCAGCTATAATGTCAATATAATGGGATCCTTACAATATAATGGAGTC
ATCACTTTTAGATAGGTTACCATTAACCGACATTTGTGTTTCAAGAAACCCTTTGACTGC
TGTT
