- Region 'REG00000629'
Cis-regulatory Region
Name
KH2012:KH.S618.6.v1.A.ND1-1 -4946/247
Short name
n/a
Region ID
REG00000629
Status
Curated
Origin
natural region from C. robusta formely Ciona int. type A
Type of Activity
regulatory_region
(extended_promoter)
Author
Kusakabe team (2010-01-15)
Annotator
Clara Degos (2010-07-12)
Curator
Delphine Dauga (2010-03-01)
Conversion to aniseed format of DBTGR database entry from Kusakabe team.
Transcription start site is based on the start of the first exon of the KH transcript model.
5,39010,581
Motif Name | Binding Factor(s) | Sequence | Position in Region | Comment |
---|
Aniseed Coordinates: [5,390 / 10,581] on scaffold KhS618
Sequence from JGI V1.0.
TGACCTTTTTATTCCTTGCTAAAATACCATAAAAAATATTAATGTTTATATCTAAGTTAA
GAAAATAAATCTGAAAAAAAAACATTTAAATCTAAGTTTAAATAACTTGTAGGAAAACAA
CGCCGCAAAATTTACCTGTTAAGGTTGCAAACCGGCTTCTTAGTTCGATAGTGATCGTTT
CTTAGGTTGGTGTGCCAAATATTGAAAATACGCGGTTTATATAACCGACCTGGGAGATGG
CTCATTTTTTTCTTTTTGTCCCAAGGCCACCGTTGTCGTATTCCAATCTCTGACGTCAGT
GGCATATAGGCGTCACGCATGAATTAGCAGAACTGATTTGTGGAGATATTTTAAATAATG
CATTTTCTGTTTTTGCTTAAAATTCCGAACGTGTTAGTTCGTTTTATCGCCTTGTCAAAG
TTCACGACTTTAAGTTTTTTTCCGCGTCGATAAATAATTTATTGCAGTCTTTAAAAGCAT
GTTGACAACACCCCGTATGATCAACTGCACTGCACGCCAAAATATAATTATAGTAGCATT
TTGAAATGTCTTAAATTGGCGCTATTTCTACATCACTGCTAAGGGTTTGTTCAAAGTAGC
GCGGGGTAAGACAGAACACCTTTAGTACATAATTTTCAAATATCTCAATCTTATTTTAGG
CAATTAACAAGGGTCTATGGGAGTCGTGAGGATACGTTTTGATAATTCTTTGAATGTTCT
TTTATTACTACCCAATGAGAAGAGAAAATAAAATGAAAAAGTGTCCCACTTTCCCCACCT
TACTACACTATTTAAACTGTCCTACTATTTATTCATACGCCACAGACGGCATATAATATG
ACGAACTGATAAAGAATGACAGATTTATTGGATCTGAATGTTGTATAAATAAGTTACAAA
TCACATGGGGTGGGTTCTCAAGGTCTGTTTTCTTTACGTGGAAATAGAACAAACCGATTT
AGCAAATAAAAGGTCGCGTGTTCGGGACATATGTCGTTTATGCTTGGCCGGAAATACAAA
TAGCGATATTCCACACATCTGTTATGTTTATGTAGCTACGGCCTTGGCACAATGCCACGA
ATTATAATTACTGAGGCGTTCAATGCTAAACTTATTACGGTTATCGTGTGGAAATATTCA
AAACAAAATTGGTTAAACGTCGTAAAAATTATACGTGTTTATAACGAGACAAAGAAAAAA
TTGCTCTGACCGATTCTTATCTGTTCCACTATATTCTATAAAATACGTTTGCTCCCCACA
AAAGTTAATTACACAAACCATTCTTACTTTTTATAAATAAGTAGTCTTCTTTAGATTTTG
TTTGTTGGATTTTAAACTTGCCGTGTAAACATAAAAACGTAAACTTGAGAAAATGTTTAA
GCAGTAAAAGTTTTAGATCTCTGATACAAATTATTATTATTATTAATCGATTGTATAATC
TTGTATCTTCTGTGAATTGATTATGTGCTTTACTTTAGGTAGATTAATTGATTTGCAACT
ATTAGTATCTGAATACTGCAGCAATGGAAGTTAACATATATATATAGTAGGGTGGGGTAA
GATAGGCATTTTTCATTCTTTTTTTCTGTACCATTTGGTAGTAAACAAAGAGCATTCAAA
GAATCATAAAACTGTATCCTTACGACTCCCATAGACCGTTGTTAATGGTTTAAAACACGA
TCAAAATATTTAAATATTGTGTGTTAAAGGTGTCCTGTCTTCCTTAATCCTGCTATGTAG
TAGCATGGCCTACTCAATACATTGAGTAGGCCATGGTAGTAGGGTGGGGTAAGATGGGCA
TGTTTGCATTTTTATTCCTTGTACCATTTGGTAGTAAACAAAGAATATTTACAAAATTAT
AAAAATGTATCCTCACGACTTGACATTTAGTAATAAACAAAGAATATTTACAAAAGCATA
AAATGTATCCTCGTAAGTGTTAACGGGATCCCATCTTACCCAATAGCACTGTGGCTTCAA
ATAATGAACCAAACTTTAAATAACGCGTAGTTTATTCTGGCTACAGCAGGCTGCACAGTT
GGTGCGTAAAACGCAAACGACATTGGTATAAACATACATCAGGATTATCCAAAAACAGCG
TATACGCAGCAGCTGTTTTAAACAGATAAAAGTCGGTGGACGCCATACCACATGCGGTTA
AACGCAACGTTGGTTTTCACATTTCAGTATACAATTTTTAGAATTTTCTGCTTTTTCAAT
AATATACAATTATGTTTTTTAATAATAACCAATTTCCCATTTTTCAATAATATACAATTA
TCTGTTTTCAATAATATATATTTTTCTATTTTTAATAATATACAATTTTGTATTTTTCAA
TAACACAATTTTCTGTTGACGTGTAAAGAACTGTTGTTTTGATCGTCGCAATAACAAGAA
TAGTAATGCGTGAATACCCTTGAGTAAAATGTTAATAACGTCTTGTTTGTGTATTGACGT
ACTATGCAATTACTATATAGTAGGGTGGGGAAAGATGGGACATCTTTTTTTCTATTTTCT
TGTCACATTTGGTAGCAAACAAAGAACATTAAAAGAATTAAAACAATACATCCTCACGAC
GCTCATAAACCGTTGTTAATTGTTTAAAACACGATCAGAATATTTAGATATCATAGTATT
CCATCTTACCCCACAGTATTAAATGTACAAATAAAATCAATTTGTCTTTTTGGGAATGTT
TTGCCAAATGATAGAACTGTGACTGTGCTTGTGGAGTGCCCAATTTATCAAAACTGTCAA
CTTTGCGGTGGCATATATGACGTATTATGCCACTTATTCCTTCACGGCATATACCGTATT
GATTACAAAATAATTAGACCACTGCATGCAGGATTAAGTAACCTCGTTGGTGGAAAGTGG
TGTGGTATAGCTACTTCTTATTAAAAACAGATTTATACGGTTGCGGGTTACCACATGCGT
TATGGGCCACTTCTGGGTAATATTGCCCAAAGCTTTGTGGTTAATTTAGTTCTCTAAATG
TTCATATTTTGACAGTAGAGTCATTAAAGTATTCGTTGCAAAAATTAGGATTTTACTATT
ACGTTATGGAATTTTTAAACGTAGCTACGATGGGCAATGGGTTTCTTTATCCCCTTTGTG
GTTAATTAAATGCCTAAATAGAAATTAAGGTGTTTTCCCAGTAAGACTATGTCACGAAAT
AAAAAAGAGCAAATTTCCATCGTGTTTACGTTTAGATGTATAGATTAATCTACATACAAT
ATTATGACACCGTTTTAAAGATGTTCTGTTTTTATATACAGTCTATTTTGACCTCATTAC
GTCAACTACAAATACCTTGATTGTAGTTTCTATAAGTTTACAGCTTCAAGCGCCGATTTT
AAAACTATTCGTATCTTTAATCCTGCTGCTGGAGCAAAACACAACACCTCGCTTTGAGCG
TTGCCTTAGATGGGGAGCAGTGTTCCCTGTGCCGTTAGCGTCTGCTGGTCAAATATTATA
GTAAAGGAAGAGTATATAAAAATTAGGAAACACTTAAAAAAATTCATTTCGACCCGCAAA
CAATGTTAATTACCCTCCCCGCTTTTCTTGATTTACCGCACTTCTGTAACTTTAACATTT
TAACTTGCTGCAGTTGCAGGACGTGTCACTTCAGATGAAGCTCGTTGTAAACCATGCTGG
TTGGATTATTTGTTTCTCCTGCAAGACATAAGTTAAGTAGTATATTATCAAACTAGTTGA
ATGAATGAATGTAGTTTTGTTTGCTTATGCAAATATTACTATTCCAATATTCTATGTTTA
AAATAAGTTATTATAGCTATAATGTTATTATACAGTATATAGTATTGTGCCTTGTGTTTA
TATTATTCTTATTTTATTATTACTTTATTTCTGATTGACAACTTTTTTTCGGAATCGACG
TCGCTTATTTTTCCGTAACTAAATACGTCACTCGTGGCTTGAAATCGTTTACATAATTTA
TCCGTTCGTAATACGTCACTCAAATGACAACGTGTCTTAACCGTGCGTCGTATTCGCTTA
CGCTCGCAATAACACGTCATAGTTACGCTCTACTGCGCGCTTGCGACGTTACGTTTCGTT
TTTTTTGTACGCATGCGTTATGCGACGTTTTTGATTTCATGGGCCCCCATGCGCGTTTTG
CGTCTTTCCAAGGCACATTACTAGCATATCATATCTTCGCGTTATAAGCGCTCATCATAT
GTATGTGTTATAAGCGCTCCAGCGATGTAGGAAGAACAAAGAATTGGTAAGTTAATTCAT
ATTACGCATTGTTACGTACACCATGCTATTTTCTAGAATTTGAGATGTGACGTCTTGAAG
TGGTGATGACGTAACAGAACAACCAACTTCGTAAGTTGTTTGTTTTTGTCCTCAACTAGC
TTTTATGTGACAGGCTATTATTTTTAGAATATGATATATATGTGACGTCACAGAGGATTA
AGCGGACCATCGCACATAAAGAAGAATGAAGGTGATAATGACATAATAATACATAAACAG
ACAATTACCGATTATATTTTTGCAGAAATATCGGCACTAAGCTGCAGAAGAAAAGCACAA
GGTAAATGAATTATCATTATTGTTTATCATTAGAATATCCTATTTATACTCGCCTCGGGG
GTAGCGGGGCATCTTCAGTCTTTACCCGTGGTGTGTTCTGTTTCATGCACATGGTGCCCG
CTAACGAGTTACCACATACGTAACCGTAGTCTAATAATACAACTTCTTTATTAAACTATG
ATGTATCTTTGAAGGTGATTTTTTCATATTTTTGTGTATGGCTGGCAGTGTATAAAATCC
GTAAGGAGACCATTAATTGCAGCCTGGGACGTTGCTGCTAAACAAATAAATAAATAAATG
TTTTTTACCGTAAAATGTTTTATTTTTCATGCTGAACTTTATAGGAATGTATATGCTATA
GTATAGGGTGAGGGAAGATGGGACACCTTTTCATTCTGTTTTCTCGTCCAATTTGGTAGT
TAACAGCAAGGATAATGCAAAGAAATATATAACCGTATCCTTACGACTCCCACAAACCGT
TGTTAATTGTTTAAAGCACAATCAAGGTAATTGGATATTATGAGCTAAAGGTGTCTCATC
TTCCCCCACCTTACTATATGACGTTTTTTCAATTTGTATCGTAACTATTTTGTTTTATTG
TTTAGCCGAAGAACAAAGACGAAAACGCCATT