- Region 'REG00000592'
Cis-regulatory Region
Name
Ci-Prx -7213/1
Short name
n/a
Region ID
REG00000592
Status
Curated
Origin
natural region from C. robusta formely Ciona int. type A
Type of Activity
regulatory_region
(extended_promoter)
Author
Kusakabe team (2009-12-12)
Annotator
Delphine Dauga (2010-01-11)
Curator
Delphine Dauga (2010-02-26)
Conversion to aniseed format of DBTGR database entry from Kusakabe team.
Transcription start site is based on the start of the first exon of the JGI transcript model.
1,327,2191,334,432
| Motif Name | Binding Factor(s) | Sequence | Position in Region | Comment |
|---|
Aniseed Coordinates: [1,327,219 / 1,334,432] on scaffold KhC12
Sequence from JGI V1.0
Show sequence
Length: 7,214
TCTTCAAGGAAAATACCCGTCTAATTTTTTTCTAAATAACGAAATATGAATTAAAATCTA
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ATGTGAAACAAATCTAATAGTTGGTTGTAATTCTCACTGATTTATGCAGTGCAACAAATA
ATAATAAGCCACCCCAGGTTTGGCGCCTATGGTGAATTTAATAGCTTTTTTATGTCTACA
ATTCCCAAAAGCTCCGGTATTAAAAAATTAGAACTAAAATGACAGTGTAACTTGAAACTG
GCACGAGGTGTATGATACAGAACACCAGTGTTTAACAACTGTTTTTTTGGCCACGCGAGG
ATAAAGTAAGATTTAAAATTGTTTGAGAAAATACTACATTTTTTAAAATGCTTGAGAAAA
TACTTTCGAGCCGC
