- Region 'REG00000569'
Cis-regulatory Region
Name
Ci-GnRHR2 -4382/56
Short name
n/a
Region ID
REG00000569
Status
Curated
Origin
natural region from C. robusta formely Ciona int. type A
Type of Activity
regulatory_region
(extended_promoter)
Author
Kusakabe team (2009-12-12)
Annotator
Delphine Dauga (2010-01-11)
Curator
Delphine Dauga (2010-02-24)
Conversion to aniseed format of DBTGR database entry from Kusakabe team.
Transcription start site is based on the start of the first exon of the JGI transcript model.
4,004,2834,008,720
| Motif Name | Binding Factor(s) | Sequence | Position in Region | Comment |
|---|
Aniseed Coordinates: [4,004,283 / 4,008,720] on scaffold KhC3
Sequence from JGI V1.0 <br />
Show sequence
Length: 4,439
TCTATACGACTCAGATCGTTCAACTTAATAAAACTTAACCATTATACTTACTCCTTTTCC
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