- Region 'REG00000566'
Cis-regulatory Region
Name
Ci-Pax2/5/8b -5245/210
Short name
n/a
Region ID
REG00000566
Status
Curated
Origin
natural region from C. robusta formely Ciona int. type A
Type of Activity
regulatory_region
(extended_promoter)
Author
Kusakabe team (2009-12-12)
Annotator
Delphine Dauga (2010-01-11)
Curator
Delphine Dauga (2010-02-26)
Conversion to aniseed format of DBTGR database entry from Kusakabe team.
Transcription start site is based on the start of the first exon of the JGI transcript model.
1,548,4431,553,898
| Motif Name | Binding Factor(s) | Sequence | Position in Region | Comment |
|---|
Aniseed Coordinates: [1,548,443 / 1,553,898] on scaffold KhC12
Sequence from JGI V1.0
Show sequence
Length: 5,456
TCAAACAACTGAACTGGACCAGCAGGGCGCTATGCAAGAAAGCAAAAAACAGCTGAGTCA
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TTACAAACTGTCACGCAAAATCCTACAGTTTTTACTTCTTGATATAGAATCTGAAAGCTT
CAGGATAAGTTTACTGTTTTTAAAGAAAATATGTTTGGTGTATGTTTGCTACGGAA
