Login
Help

CIS-REGULATION

Submit your Data

  1. Region 'REG00000561'

Cis-regulatory Region

Name

Angiotensin receptor -3319/-8

Short name

n/a

Region ID

REG00000561

Status

Curated

Origin

natural region from C. robusta formely Ciona int. type A

Type of Activity

regulatory_region
(extended_promoter)

Author

Kusakabe team (2009-12-12)

Annotator

Delphine Dauga (2010-01-11)

Curator

Delphine Dauga (2010-02-24)


Description

Conversion to aniseed format of DBTGR database entry from Kusakabe team.


Transcription start site is based on the start of the first exon of the JGI transcript model.

Overview of functional TF binding sites in this region

1,556,5001,559,811

Motif Name Binding Factor(s) Sequence Position in Region Comment

Sequence

Aniseed Coordinates: [1,556,500 / 1,559,811] on scaffold KhC11

Sequence from JGI V1.0

Show sequence

Length: 3,312

TGCCTAACAGAGGCAATTCCTCTAAATCACAATCTGGCAATTGGAAATGAAAAAAAAAAC
AAGTTTTAGTAAGAGTTTGGTGCGTCAAAAAACACAAATTTTTTATGTGGATTTGATGTT
CTTGTACACCCAGTTGAAGTGGAGATTTCTTGTGTTGTTTTGTCCTGGAACTAGGCAATA
TTGTACATATATATATCATGAGTACACCACAGTAATCACAATAATGGAAGCATGCAATTA
TAAATCTAATATCTTTTGGTTTTAAATAATTTACCAGCCTAACTATTCTAAGCTGTCAAA
CAGATACAACAACATGAGGAAACTGATTTTCGTTTGTATTACACCGCGAAATACAAAATA
ACAGTCACATTTTCAGTTTATTCGTAAAATTCAACCTGTATAACTTGAAATAAACTGAAT
TTAACAAAATAATTTGTGGTTTCAAAAAAGGGTGTTTTTGGTATAAAAAGTGTAATTTTC
TTATTTTTTAGGTTACCAATTTTGGTAAATTTTTGATTTATATTCTCTTAAATTTAAATT
ATCCGACGTTTCAGTGGTTATTTTTTGTATGCATTTTGCAACAAAATGGGAATAAATATT
TGATCAGCAGCCGGAAAAATAACATATGCCATGAATCTGGTGCTTTAACGGTTTCCTAAT
ACATTTGCATATTGCAGTTAGAGTAATGCAACCACATAAACCATTACATTGGCTTTAAAC
AACCACCACTTCTGTTGTAATAATAAACTCTAGGTAATGTTTCGGAATTTTACAGTGCAG
AAAAACGAATAATTGCTTCGTGTACGCAAAAAATCTACTTTTAGGATAGGACAAACTATA
GTAAAACCGAATGAAAGAAAATTGTAATTTATGAATACATAAGCATACTAAATGTTTAAG
CAATATGGGTTCCTAGTGCTTTCATAAATAATTGTCTTGACTAAGTTTTAAAATGCAAGT
GACAACGTTTATGAAAAGCGGTCAGCGGTTCTTGTATTATTTATGCCGAAAGTATACGCT
TTCTTTTATTGTGTGGTTGTGTATTTGAATTGTGTGCACGCGCAAGTCGACTGGAAAACG
CAAAGGTACATTTAAATTATTTTTACTGTTGCTTTTGATTAGCTTGGTTCGTAATTTATA
CATCTTTTATCAGAACATGAGTCGTAACAAATCAATTAATTTTTTAGTCTTACGCGGCAT
TAGTAACCGTTCAATATTTGAGAATCTCAAAGGACGGTTCGCGCTGCTAATTTATACTAT
ACGCTACAGTGCGGATTGCGACATGATATAGTATATACATATAGTATATCATTAAAACTG
TCCCTATGCTCAGTTATAATGAAAGTAGGTCAGCTTAGTTGCGTCATACTGTTGTATTAT
TTTGTAAACAACGCGTCGTACACAACTACTCGTTATTTGCGACTAATACGCGGCGTATGA
TGCGCATTGCCTCACGAGTCATACGTCATTTTTTGTAACGCTTTTAAAATTAATAAAGCG
ACCGAGGTGTGCCTGGATTTTACGCACATCACTTAGTGTTGAAGTAGAAAATGGTTAAAT
GAAGTTAAAATCACAACGTTCGTGTTGTTGTGCAATTCGGTCACGACAGGTCATAACATA
ATTAAGCTTTCAAGTGCGACTCATCCGCGCAGTGACCCCGTGCTAATGCAAGTTAAAGCT
GTGGCTTAGAGGGGGAGAAATGCGGAGAGGAGAAAAAGAGCAATGCAATCAAGGTTCAGT
GCTGAAGAGAAAGTGAGAGGTGGAAACGAGAGAGTGAAAGTGAAGAACAGCATGCATAAT
TAAGCTGTTGTCCAAGGGCAAAGAAAGCGCACACCCCACTTAGTAAATATGTGCTGCTAT
ATGTTTTCAGTTAGATAGAAGCATTGCTATGTATAAATATATATCATGCTTGTAGTTCCT
CTGAGGCAGGTTTATATGTAAATGCAGAGCAGTTGTATTAAAAAGAACTAGAACAAGTAT
ATTGCTATGGTAACTACAATCGTCGGGGTTGATTGCTTTTTTATTGTTTTACAACTTAGC
GCAAGAATGTACACTTGTACGTCATGTAGCATATTTATCTAAATGTGTGAACAAACCTAT
TTTGTGAAATATTCATCCGTGGCAAAATATATAAGTTTCTCTTATATTTTTATTCATAGC
TGTATATTTTTATTTTTATAATTATATGATGTTATATATAGAAATTATTACGCCTGGAGT
TACGAAGATTTTAGGCTTTCGAGACCATACATATTCTATTCTACAACGCTAGATGCAAAT
GATACAAATTTATGAAACCGATCTATATAAGTACAGCAGTTGTCCGCCTCCAAATAAAAC
TTTAACACGGCCAAGTTATTATCTGCAAAAGCATATCTTCCATTGCGTAATTATCTATTA
TTTTCGGTATGCGCTGACGTTGTCCAAATTAATTATTACGTTGAGGCAATCGCGTAAGCC
TTCTTTATTTTGATATGTCCCGACGAAAACCGAATGGTAGCAACGAAAGTATACCCCGGT
TCTAAATTTGTTGTTTGTTGTTGTTTTTTATTGTATTACGTTAAGTTGAAAAATCTTGTG
AAATTTTTAATTTTTAAAAAATTTAAAGAATTCATTAGATGTATGTTTGATTTCACAAAC
GTTATGGCATTCTTGCCTCAACACGCTTGCTGCGTTATAAATCTAAAGGAATCCGACACA
ATTCCTTAACAGACTTTTCGCTTAAAGCAGAAATCGAAAAAAACAGCCGTATGTTCATTA
CAGCGCGAATGAAATTGATTTTTCCGGTTCGTTCTTCTGCCCGCCATCATTTATTTAGCG
TTCTGTCTAAATGTATCACGTCGTGTCCAGCTGTTCAACTGGGTGTCCATTAAATCAGGT
GCTTTTGACGTGATCAGTTTGCCAAGTAAGAGAAATGTACCAGTAATAAAATGTCTGTTC
TCTTATCTCGTGTTCGTTTTAAGGTCTTATTTTAGGACGCCATGGATTATTTTATGAGCT
ATCGGCCTTAGCGCTGTTATTTTAACCACCTACTGAACAATTAATTATTAATGGGTGCTT
CTAAAACCTTGTAATAAGAATAATGTGATGCCCCATTAGCAAAAACATGCCGTAATACGT
TTTGCTTATTCCTGTTATACATGATCTAATTACTCAGAATACATTAAACTGAGTGAAGGT
ACAGCAGGGCGAGTGCTCATTTAACTTTTGTTACAAGTTTAATCTCTTTCACAGGCGTGT
GTTTAAAAGTATATATCATGGTTAAGTAATTCTTTGACATATACTCCCGGACCTATGTGA
GTGAAACCTGAA