- Region 'REG00000553'
Cis-regulatory Region
Name
PAM -3000/654
Short name
n/a
Region ID
REG00000553
Status
Curated
Origin
natural region from C. robusta formely Ciona int. type A
Type of Activity
regulatory_region
(extended_promoter)
Author
Kusakabe team (2009-12-12)
Annotator
Delphine Dauga (2010-01-15)
Curator
Delphine Dauga (2010-03-01)
Conversion to aniseed format of DBTGR database entry from Kusakabe team.
Transcription start site is based on the start of the first exon of the JGI transcript model.
4,388,3864,392,039
| Motif Name | Binding Factor(s) | Sequence | Position in Region | Comment |
|---|
Aniseed Coordinates: [4,388,386 / 4,392,039] on scaffold KhC4
Sequence from JGI V1.0.
Show sequence
Length: 3,654
CAAGAAGCTGACACAGAGGACGACGATGACGAATAAACAATGAAATATATGGGACACTTG
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