- Region 'REG00000546'
Cis-regulatory Region
Name
Ci-GnRHR3 -7941/-2200
Short name
n/a
Region ID
REG00000546
Status
Curated
Origin
natural region from C. robusta formely Ciona int. type A
Type of Activity
regulatory_region
(complex_region)
Author
Kusakabe team (2009-12-12)
Annotator
Delphine Dauga (2010-01-11)
Curator
Delphine Dauga (2010-03-12)
Conversion to aniseed format of DBTGR database entry from Kusakabe team.
Transcription start site is based on the start of the first exon of the JGI transcript model.
4,012,3714,018,112
| Motif Name | Binding Factor(s) | Sequence | Position in Region | Comment |
|---|
Aniseed Coordinates: [4,012,371 / 4,018,112] on scaffold KhC3
Sequence JGI V1.0
Show sequence
Length: 5,742
CGGTTAAGCAAACTGTTAGCGTGTGAAAGATCGTTATTTTATCAGGTGGGGAAAGGCGTA
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