- Region 'REG00000519'
Cis-regulatory Region
Name
KH2012:KH.C10.493.v1.A.ND1-1 -4271/74
Short name
n/a
Region ID
REG00000519
Status
Curated
Origin
natural region from C. robusta formely Ciona int. type A
Type of Activity
regulatory_region
(extended_promoter)
Author
Kusakabe team (2009-12-11)
Annotator
Delphine Dauga (2010-01-11)
Curator
Delphine Dauga (2010-03-01)
Conversion to aniseed format of DBTGR database entry from Kusakabe team.
Transcription start site is based on the start of the first exon of the KH transcript model.
4,541,4164,545,761
Motif Name | Binding Factor(s) | Sequence | Position in Region | Comment |
---|
Aniseed Coordinates: [4,541,416 / 4,545,761] on scaffold KhC10
Sequence from JGI V1.0
CCTAGATTGCGTGATGGCCTATTAGCATGACGCGTAAGCTCTGGTAAATGTTACCGATTA
TTTTATCGCCTCATTATCCAGCAAAAGCCAAAGCCGGCGTAGGAATACATCAAGCAAATG
TGTGTGCAATCGATGCATTAAAGTCGAAGTATTTAAAAAGAAAACATTTTTTTTAGCGGC
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