- Region 'REG00000487'
Cis-regulatory Region
Name
Ci-opsin1 -4962/38
Short name
n/a
Region ID
REG00000487
Status
Curated
Origin
natural region from C. robusta formely Ciona int. type A
Type of Activity
regulatory_region
(extended_promoter)
Author
Kusakabe team (2009-12-09)
Annotator
Delphine Dauga (2010-01-14)
Curator
Delphine Dauga (2010-02-26)
Conversion to aniseed format of DBTGR database entry from Kusakabe team.
Transcription start site is based on the start of the first exon of the KH transcript model.
201,401206,401
| Motif Name | Binding Factor(s) | Sequence | Position in Region | Comment |
|---|
Aniseed Coordinates: [201,401 / 206,401] on scaffold KhL171
Sequence from JGI V1.0
Show sequence
Length: 5,001
TGTTCAAGTTGTGCGGAAATTATTCTCTTTTAGAACGTTTGTGACAAGTATAAATAAATC
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