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CIS-REGULATION

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  1. Region 'REG00000405'
  2. Region 'REG00000404'

Cis-regulatory Region

Name

Ci-Pax6 -2500/7000

Short name

n/a

Region ID

REG00000404

Status

In Process of Manual Curation

Origin

natural region from C. robusta formely Ciona int. type A

Type of Activity

no_output

Author

Steven Q. Irvine (2008-06-15)

Annotator

Émilie Carmona (2008-06-17)

Curator

Delphine Dauga (2010-02-26)


Description

Construct(s) made to test this region
n/a
Overview of functional TF binding sites in this region

5,699,9285,709,427

Motif Name Binding Factor(s) Sequence Position in Region Comment

Sequence

Aniseed Coordinates: [5,699,928 / 5,709,427] on scaffold KhC9

Sequence from JGI Version 1 thanks to coordinates in the paper.

Show sequence

Length: 9,500

TACACATATACATCTGGATTGCTAAGCTGGTATATAGGAATGAATTGGCAGAACTTGAAT
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