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CIS-REGULATION

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  1. Region 'REG00000402'

Cis-regulatory Region

Name

Ci-FoxD -3600/1

Short name

n/a

Region ID

REG00000402

Status

Curated

Origin

natural region from C. robusta formely Ciona int. type A

Type of Activity

regulatory_region
(extended_promoter)

Author

Ute Rothbächer (2008-04-13)

Annotator

Émilie Carmona (2008-04-14)

Curator

Delphine Dauga (2010-02-24)


Description

This region drives expression in A- and B-line.

Overview of functional TF binding sites in this region

2,619,5082,623,110

Motif Name Binding Factor(s) Sequence Position in Region Comment

Sequence

Aniseed Coordinates: [2,619,508 / 2,623,110] on scaffold KhC8

This sequence was based on JGI Version 1.0.

Show sequence

Length: 3,603

GTAGGCCGAACCGATGACATTATCTCGTGATGCTCCGTGAGATTCAATACGATTCATCAT
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CTT