Cis-regulatory Region
Name
Ci-vAChTP -3791/-1
Short name
n/a
Region ID
REG00000031
Status
Curated
Origin
natural region from C. robusta formely Ciona int. type A
Type of Activity
regulatory_region
(extended_promoter)
Author
Kusakabe team (2007-01-24)
Annotator
Delphine Dauga (2010-01-15)
Curator
Delphine Dauga (2011-08-17)
Data from DBTGR (Sierro et al., 2005). Region from -3791 to -1 from the start codon allows expression in neurons of the brain vesicle, the visceral ganglion and the dorsocaudal epiderm. Reference for promoter is: Yoshida, R., Sakurai, D., Horie, T., Kawakami, I., Tsuda, M., Kusakabe, T. 2004. Identification of neuron-specific promoters in Ciona intestinalis. Genesis (39): 130-140.
4,530,8634,534,652
| Motif Name | Binding Factor(s) | Sequence | Position in Region | Comment |
|---|
Aniseed Coordinates: [4,530,863 / 4,534,652] on scaffold KhC1
This sequence was found using a blast on the JGI V1.0.
Show sequence
Length: 3,790
TTTTAAGCACACGTTCAAAAATTTAATAAAAGTTACAATAAGTTATTTAGCGATTTGCAC
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