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  1. Transcript 'Phmamm.CG.MTP2014.S2...'

Transcript Model

Transcript Id

Phmamm.CG.MTP2014.S297.g06886.01.t

Possible name(s)

PLOD1; PLOD2; PLOD3

Location

S297 [133,653 / 150,263]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 725

>Phmamm.CG.MTP2014.S297.g06886.01.p
LVLFAQSGLTTQEATDSTSDLDLLIVTVATDETDGYKRFADSLKYFNLDVLVLGMNEEWT
GGDVRVTVGGGMKVNLLKKALGKYKDNQNLVLFFTDSYDVVFAAGKDEILGKFKNFNSKL
IFSAETTIWPDASLKSQYPEVNVGKRFLCSGGIIGYAPQFWAAINQWDLVDTDDDQLYYT
KLYLNEGIRAELNMSLDHTSKLVQNINFARSELELVEQETTSRVKNVKYHTFPSVIHGNG
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FLQRIEKLSYPKSRIALFIHNNEQTLERVVAQFLLRHRSKFNSVKVVAPHEQVSELEARQ
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MNQVGYEKQWLHLLATYPLKVVQKVYPGYDSKAHSIMMFVVRYKPSEQPFLRPHHDSSTW
TMNVALNTHGQDYEGGGCRFLRYNCSATQIPKGYALIHPGRLTHYHEGLQTTKGTRYIAV
SFVDP

Nucleotide sequence

Length: 4,241

>Phmamm.CG.MTP2014.S297.g06886.01.t
CTTTGGTTTTGTTTGCCCAATCTGGCTTAACCACCCAGGAAGCAACAGATTCAACCAGTG
ACCTGGACTTGCTGATAGTCACAGTGGCTACTGATGAAACTGATGGCTATAAACGCTTTG
CTGATTCCCTAAAGTATTTCAATTTGGATGTTTTGGTGCTGGGTATGAATGAGGAATGGA
CTGGTGGTGATGTTCGAGTTACTGTTGGAGGTGGCATGAAGGTCAACCTTCTTAAAAAAG
CTTTGGGAAAATACAAAGACAACCAAAACTTGGTCCTTTTTTTCACAGACAGCTATGATG
TTGTTTTCGCTGCGGGAAAAGATGAAATATTAGGCAAATTTAAAAATTTCAATTCCAAAC
TCATTTTCTCTGCTGAAACCACGATATGGCCTGATGCTTCATTAAAGTCTCAATATCCTG
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TTTGGGCAGCGATCAACCAATGGGATTTGGTTGATACAGATGATGACCAACTTTATTACA
CAAAACTTTATTTGAATGAAGGAATTAGGGCGGAATTAAATATGTCTCTTGACCACACAA
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ATACTGGGTGCAGAAAATGTGAACAAGATCTGTTGGACCTGTCCAGTCTGGAGCAGGAGG
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AGTTTCTTCAAAGAATTGAAAAACTATCGTACCCTAAATCGAGAATTGCCTTGTTTATAC
ACAACAATGAACAAACACTGGAAAGAGTGGTTGCCCAATTTCTTCTTCGGCACAGATCGA
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GGCATCTGGTGGTTCCAGATTTGAAGGTGGACTCAGAAGTGCATCCTGATTTATGGCAGA
TCAAAGCCAATGCAAAGGATTGGGAAGACAAATACATTCACCCTGGATTCTGGAACGCAA
CGTTAAGTGAAACGAAAGTCACTCAACCTTGCCCTGACGTGTATATGTTTCCGCTCTTCA
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TGGTTCGGTACAAACCCAGTGAGCAACCGTTTTTGCGTCCACACCACGATTCAAGCACCT
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TTTTGCGCTATAATTGCTCCGCAACTCAGATTCCTAAGGGTTACGCCTTGATCCACCCAG
GCCGTCTCACGCACTACCATGAAGGTTTACAAACAACCAAGGGCACTCGATACATTGCCG
TGTCTTTCGTTGACCCTTGATTGAAATACAGTGGTCGTGAACAGTCGTTGCGTTGCTTTT
CTGTAACTAGTTTGTTCGATGAGTACAATTTTTCTCCTTGTTTTTGTATTTAAACTGCAG
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TGCAGTGCACGTTTCTTCCTAGACAAATTTTCGCTTGTTTTACTCCCCCCCCCCTGCAGT
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GCAGTGCACGTTTCTTCCCCGTTTCTTCCTTTCTCTCTTTTTCTGTACCCACAATGTGAT
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TAAATGTTTAATGTTCATGCACATAGCGTTATAACTTACACTAACATAAAGACTTTTATG
TCAAGTAGCGTCAGAAACTTAGATTTCAACTGTGCCAAAACCTCCTTTGTGGTGTTCAAA
ACAATTAGTTATAGCGCATAGCGATATACCGTTACAAATTACGTTTGTGTCAGAAACATT
ACACCAGTTGTACCACATATTACTTAAACCAAAAACGCAAAATGTGTCCAATGGCCTAAA
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TGCCTTTCCTGAATGATAAATCGTTTAACCCAGCAGGGGTGTCCAACTCGAACAAACCGC
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GAGTATTACACAAGATACAAATAGTTTGCAGCAGGGCTTAAGTTTTTAAAAAACGAACAA
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TGAATGTGCAAAAGCTTGCGTGTCATTTTCAAATGCTCTGCGTGCCACGTGTTGGGCACC
CCTGGTTTAACCAAACATAACGACCCAAACCTAATATATATGGCGTGTTATTGTTATTTG
ACAAAGTCGGTTTTCGTATGTATTATTTACAAACCCCGCTTATACATACATGTAATCATA
TACGCCACTGTAAATACACATGCTTACTTATAACCGATGTATATCAGTACTAACCCTTGC
GGCTCTTGAAATCGTTACCGATTCAGTATTACTTGCTGTAATTACTTGTAATTATGCGCA
ACTGTATATTCTGTAGTGTGCTTGATGTTGTGTATGTCTCTTGCAAAGTCTTGTCGCTGT
TTGTAAAGTTCTTTCATCAGCATTGAGTGTAACTGTCCTAAACCACTTTTTCCCGTGTGC
ATGTGCGAATTCGACTCAAAGCATCACAACCTTTTATATATTTTGTCTGCAAATAAAAAA
GCGCCCGCTTTATGAAACAATGTATGTTGTTACAATATCTACTGATGGTCATGGAATTCA
AAATAACTGTTTGACAAAAAAAACTTTCTGGCATAAATGAAATATATTCGCGCAAAATTA
AAGGAATATAAATGCGTTTTTAGCTTTAAATTCTTCAATATAAAATTGCATTCGTCAATT
CGGCTAAATAAATAAACAAGAGTTGTACTTTTATCGAAGCGTCAGAGAAGCATCATCAAA
TTAAACGCCAACACTTAACAGGGACTACATGGCAAGTCGGCAGTGGAATTTTAGATCTCA
GTTGTAGCCAAAGCAGGTTGATTCGCTGTAACGCTGTACCACAATGTCACTTATCAAACA
CCACAACTATCCAATTCCTCCACTACTATTTTCCCACGGAACGATAGACGCCTTTTTTGC
CAGCTCGATCAGAAATTTGCATTGTAGTTTAGTGTATTGAAACCAGTGATCAGTTTTGTG
CTTATGTCCAAGTTTAACTTGTAGTTTTACTATAGCAGTAC

InterProScan

SUPERFAMILY
Nucleotide-diphossugar_trans (IPR029044) - T[298-510] 1.88E-6
SMART
Pro_4_hyd_alph (IPR006620) - T[551-724] 9.7E-17
ProSiteProfiles
Oxoglu/Fe-dep_dioxygenase (IPR005123) - T[632-725] 10.764

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
PLOD3_HUMAN 51.108 % 763 0
PLOD1_HUMAN 49.789 % 743 0
PLOD2_HUMAN 49.58 % 729 0