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  1. Transcript 'Cisavi.CG.ENS81.R58....'

Transcript Model

Transcript Id

Cisavi.CG.ENS81.R58.3299476-3303539.17755.t

Possible name(s)

RAB18; RAB2A; RAB2B

Location

R58 [3,299,475 / 3,303,539]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 200

>Cisavi.CG.ENS81.R58.3299476-3303539.17755.p
MEGNILTTLKLLIIGDSGVGKSSLLLRFTDDRFDPDQSATIGVDFKVKSLTVEGNTVKLA
IWDTAGQERFRTLTPSYYRGAQGVIFVYDCTRKDSFSHLSTWLTEVETYSTKPNIVKMLV
GNKIDMENRVVTREEGLKFARKHSMLFIEASAKTRDGVECAFEELVEKIIQTPGLWENDA
GANRGTQLNANTAPVGGCGC

Nucleotide sequence

Length: 1,080

>Cisavi.CG.ENS81.R58.3299476-3303539.17755.t
ACTATTAAAACCATATCTATCTTTAACTTCTAGTCCTATTTGTTATTCCGCAGACGAAGT
TTTTGACAAATATCAGTTTTTGGTTTTCTTGTATATTTGTGGCCTTATGGAAGGAAACAT
CCTAACTACCCTTAAGTTATTAATAATTGGTGACTCTGGTGTTGGAAAATCAAGTCTCCT
ATTGCGGTTCACGGATGACCGGTTTGATCCAGATCAATCCGCCACTATCGGTGTGGATTT
CAAAGTAAAATCGCTTACGGTAGAAGGCAACACAGTGAAACTTGCAATATGGGACACAGC
TGGGCAGGAACGATTTCGTACGTTGACCCCAAGTTATTACAGAGGAGCACAAGGCGTAAT
ATTCGTTTATGATTGCACAAGGAAGGACTCTTTTTCACACTTATCCACATGGCTCACTGA
AGTTGAAACCTATTCCACAAAACCAAACATAGTGAAGATGTTGGTTGGGAACAAAATTGA
CATGGAAAATCGGGTTGTGACAAGAGAAGAAGGATTGAAGTTCGCTCGCAAGCACAGCAT
GTTATTCATCGAGGCAAGCGCTAAAACTAGAGACGGAGTTGAGTGTGCTTTCGAAGAACT
CGTTGAAAAAATCATCCAGACACCAGGACTTTGGGAAAATGATGCTGGCGCTAACAGGGG
AACACAATTAAACGCTAATACTGCTCCTGTCGGCGGTTGCGGATGTTAATTTTCCATATT
TTGCATGTTTATAATCCGCCTGTAGTCTATTCAGGTATAAAGCACCATGGTGGAAAAGAT
ATGGTCAGTTTTAACAGATTTTTATCATTTATTAAACAAGTCTAAACATTTGTGTTGGTA
ACTGGCATATCATTGTAATATAATTTTAACATTTCTCTTTTAATAAATTTAAATGTGCAT
GGGCTTGCACTATGTTGCTATGCATTTGTACATTGCCAAAACATACTTAAATACCTGAGC
TGGGAAAAATTCGAAAAAGCGCTTGTGGAATTGGAAAATAATAAGACTAAAAATATTTAT
ATTATATGTATGTGCTTTATGTAAACATTTCATTCTTAGTTAATTTTTCTATCGCTGCTT

InterProScan

SUPERFAMILY
P-loop_NTPase (IPR027417) - T[6-174] 4.12E-58
TIGRFAM
Small_GTP-bd_dom (IPR005225) - T[8-164] 7.2E-31
Pfam
Small_GTPase (IPR001806) - T[10-170] 3.7E-58

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
RAB18_HUMAN 75.661 % 296 2.42E-103
RAB2A_HUMAN 54.819 % 184 2.79E-59
RAB2B_HUMAN 51.667 % 180 1.6E-57