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  1. Transcript 'Moocul.CG.ELv1_2.S10...'

Transcript Model

Transcript Id

Moocul.CG.ELv1_2.S104099.g09772.01.t

Possible name(s)

MCC

Location

S104099 [65,069 / 82,968]

Sequences

Amino acid sequence

Length: 579

>Moocul.CG.ELv1_2.S104099.g09772.01.p
MSYNSGSPGVQSSTVFVTPRSHFKPITDCGFTEHELYNNEENEEVEILFRKEDELNKTKA
VLNAIREERDILRRKVKELNDEMKILKMKNVDHKRRRSVDCIMTGRTHGENGISIARVAG
KVKLKRSTPAKNENDVNEKATEIYGKDFLGKNVSTSVAEQLISTLRESSNIQEILNGSQT
LPSKVQKQFEIELELAHSERDHIKSENNLLQLTLQEVKERFENIQLMFEKCEANNTAYQM
ALDYSEIGFALCKILLGKLTVDKHNSNNISSKFVTDDQFYAQLLTCVPLLINSHMSKNID
PCDTLKVVKELTYKLSWDKFSCQTKNERMLYQSIQTILCKIDVMRKTCTPVKLTSTESLN
LSPTSQLSKKSMQEADFENAILLNELTAVKKELAEAKWQNARFREDKKKIKKYGYLSGNS
TLSAKEKPSSEKRNGSPSSRSGGNSPESTKVMSLADLRIAQMTECEIGMELSQALQREKK
LESQIESMADTLQRVQKNSENRHTESQKVLDHFKTSYSKLVNNMKQLREKQSVEVCQLKQ
NIVDMTTKHQQEVSHLKDDILIFEREKENKILPDNETAL

Nucleotide sequence

Length: 3,798

>Moocul.CG.ELv1_2.S104099.g09772.01.t
CGAAAAGCGACAAATAGTTTCGCATGTTTGAACAAGACGTCGCTCACGATACACAATTAC
ATTTCAGACCATTTAATTGACTAAGTCAGTAGTGGCCAGTTATCATGTCGTACAATAGTG
GAAGTCCAGGCGTCCAGAGTTCAACTGTTTTTGTGACCCCTAGAAGTCATTTCAAGCCAA
TTACGGATTGTGGGTTCACTGAACATGAATTATACAACAATGAAGAGAATGAAGAGGTTG
AAATATTATTTCGAAAAGAAGATGAATTGAACAAGACAAAAGCCGTGTTAAATGCGATCC
GTGAAGAACGTGATATCCTTCGCAGGAAAGTCAAAGAATTAAATGATGAAATGAAAATAT
TAAAAATGAAAAATGTCGATCACAAACGGAGAAGATCAGTTGATTGCATTATGACAGGTC
GCACACATGGTGAAAATGGTATTTCAATCGCGAGAGTAGCGGGAAAAGTAAAATTAAAAC
GTTCAACGCCAGCCAAGAACGAAAATGATGTTAATGAAAAAGCAACTGAAATATATGGAA
AAGATTTTCTTGGAAAAAATGTATCAACGAGTGTGGCGGAACAATTAATATCTACTTTAC
GAGAAAGTTCAAATATTCAAGAAATTTTAAACGGATCGCAAACATTACCATCTAAAGTTC
AAAAACAATTTGAAATTGAGCTTGAATTGGCTCATAGCGAACGTGATCATATTAAATCCG
AAAATAATTTGCTACAATTAACATTGCAAGAAGTAAAAGAGCGTTTCGAAAATATACAGC
TTATGTTTGAAAAATGCGAAGCAAATAACACAGCATATCAAATGGCGCTCGACTACAGTG
AAATTGGATTCGCGTTATGCAAAATTCTTCTTGGTAAACTGACGGTGGACAAACACAATA
GCAACAACATCTCATCAAAGTTTGTGACTGATGATCAATTTTATGCACAACTTCTGACCT
GCGTACCGCTGCTAATAAATTCACATATGAGCAAAAATATCGACCCTTGCGACACACTTA
AAGTTGTCAAAGAATTAACGTACAAACTGTCGTGGGATAAGTTTTCATGTCAGACAAAGA
ACGAAAGAATGCTCTATCAAAGCATTCAAACGATCTTGTGCAAAATTGATGTGATGCGAA
AAACATGTACCCCTGTTAAACTAACATCAACGGAAAGTTTAAATTTGTCACCCACTTCAC
AATTATCAAAGAAATCAATGCAAGAAGCAGATTTTGAAAATGCAATTCTCCTCAATGAAC
TAACAGCAGTGAAGAAAGAACTTGCGGAGGCGAAATGGCAAAATGCTCGATTCCGAGAGG
ACAAAAAGAAGATAAAGAAGTACGGGTACCTGAGCGGAAATTCAACTTTAAGTGCCAAAG
AAAAACCAAGCAGTGAAAAACGAAACGGAAGTCCTTCAAGTAGATCTGGTGGCAATTCTC
CGGAGTCAACCAAAGTGATGTCGCTGGCCGATCTGCGAATCGCACAAATGACAGAATGTG
AAATTGGAATGGAATTATCGCAAGCGTTGCAAAGGGAGAAGAAACTTGAAAGTCAAATTG
AATCAATGGCAGACACGCTGCAACGTGTGCAGAAGAACAGTGAAAATCGACATACAGAAT
CACAGAAAGTACTAGATCATTTCAAAACATCGTACAGCAAGCTTGTCAATAACATGAAGC
AACTTCGCGAGAAACAAAGCGTAGAAGTGTGCCAACTCAAGCAGAACATCGTTGACATGA
CAACCAAACATCAACAAGAGGTTTCACATTTAAAAGATGATATTTTGATTTTTGAACGCG
AAAAAGAAAACAAGATTTTACCAGACAACGAAACTGCTTTATAATTGCAAAATAAACAAA
GCAAGCAATCAAGCAATGTGTATGTCTTTTATCTAAATATACGATTATATTTTTCGACTC
TGCAGTTAAATGTCAACTTTTTTTACTTTGTCGTTTTTGATATTTTGTTGCACATCTTAT
ATTTTTGCACTGCGTATTGCCAAGAAGTCATTTTCGCTTTTCTAATATGTTTATTTATTT
TTGTTTCGCATAACATGATGAAAAATGCCTTAATCTGTCTAATGTCTGCAGAAAGCAAAA
CGCAGGAGATCTGAATTAATAATACTATATACAGTTTATTTAATTTTGGTTATAACATGC
AATCCACATTTAAGTGACGCCAATAAAAAATTTAAATTTAGACGAACGGAAATTTAGTTT
ATGAAATGGGTGGATTTCTGTCAAAACTATTCGGAATTGTCTCAAAGACTCAAAAATATT
TTACAAACTATTAGTAACATAATAATTAGTGCCTCTAACTGGTACAATTCCAGAAGCATA
GAAATCAACCCCAGCCTATAGCAGCTTTGATTTAGAACAGAATGAATTATGAGCTATAGA
AACACATAAACGGTGAAATATCAGGTATCATAGTACATAGGTAATTACTCCTGTATATAA
CCAAAATAAGGTACAAAAAATAAAAGTGACATGAAATATTGCTATAGCTCTACTGCTAGG
TGGTAATAGTGTGGTCGTGTAGACATAAAAACATACAGCAATATAAGACAATGTATTCTT
GAAGCAAAGTTTCACCCTTTCATAAATCTTCCTTGAGATGTTATTAAAAAATAAAATTGA
AAAATAAAACGACGTAGATTAAGTCATTTGTTGTGAGTAAAGTATGACGTTTGAGTAGTA
AAATAGCGATAAAAGTAATTGATATTAAATTGTTACAAATGCATATTATGATAATATAAA
AACACAACACTCAAATGTCAACCGGTACCCTTCGTAAGGTGTCTTTAACATGCAATGCAA
TATAGTTGTTAGTAAACTTTTGCTCAGGTCCAGTTTCTTTATTTTGCACCAGGAATCTGT
TTCACAACCTTCGACAGGTCGACGCCGGTCAGCGCTTGCACGGCCGGTGGAAGTTCTGCC
AACAATTTTGTAACTTCACTCGACGTGCCATCACCGTCTCCTAGCAACACGATCTCATCC
ACTCGCGACAATGGAGCGGCAACTTCTGCTGCAATCTTTGGAAGTGAATCAAGTATAAGT
GACATGAGAGCAGCATCTCCGTATTGTTTGTATGCATCGGCTTTCAACCTCATACTCTCA
GCTTCCGCTTTACCAATCGATTCAATCTTAAACGCATCAGCGCCTCCAACACGTCGAATC
TTTTCGGCTTCGGCATGAGCTTGCTCAATCGTCCGTGTCCTACAAGCTGCAATTGTTTCC
ACTTTGAAAGCTTCAGCTTCCGTTGGTTTACGTACAGTCGCTTCCAATTCTCGATCTTTA
CGCGCGATCTCTTTCGTTTCGACCTCGATCTGCTTACGACGTTCCACAACTTCGATTTGA
ATTTGTTCCGAACGAATAGTTTGTCTCTCTTTCGCTTCTTGCAACTGGTACGCCAGACGC
GCTTGTTCTTGCTGCGGCGTTAACTTCTTTTTGGAAGGAAGCTTTTGCCATTTCGTACGA
TCGATTTGCATCAGCGACTTTTGTATCGGCAGAAAACTTCACGTCCATCATTTCTTTGTT
GCATTCCGCTTCTCTGATTCCAGCATCTCTTTCAGCTTCAGCGACACCGATATCAGCATC
CCTCTTAACGACAGCCGTCTGCGCTCGACCAATCGAGTTCAAATAATCCACACGATCTGT
TACATCCTTTATGACAAAACTGAGAATCTCGATACCCATCTTTCCAACGTCGGGGGCTGC
CACGTCACGTACGAGTTGCGCAAATTTGTCTCGATCTTGGTAGATTTGTTCAACAGTGAG
AGTACCTGTGAAATGCCA

InterProScan

Pfam
USH1C-bd_PDZ_domain (IPR019536) - T[201-246] 7.8E-8

Best Blast Hits in UniProt
Protein Name Identity Bit Score e-value
CRCM_HUMAN 37.229 % 85.9 1.72E-17